ශාක විශේෂිත පරිවෘත්තීය රටාවන් පැහැදිලි කිරීම සඳහා විවිධ ශාක ආරක්ෂක න්‍යායන් වැදගත් න්‍යායික මග පෙන්වීමක් සපයයි, නමුත් ඒවායේ ප්‍රධාන අනාවැකි තවමත් පරීක්ෂා කිරීමට පවතී. මෙහිදී, අපි තනි ශාකවල සිට ජනගහනය සහ සමීපව සම්බන්ධිත විශේෂ දක්වා දුම්කොළ දුර්වල වූ වික්‍රියා වල පරිවෘත්තීය ක්‍රමානුකූලව ගවේෂණය කිරීම සඳහා අපක්ෂපාතී ටැන්ඩම් ස්කන්ධ වර්ණාවලීක්ෂය (MS/MS) විශ්ලේෂණය භාවිතා කළ අතර, තොරතුරු වල සංයෝග වර්ණාවලීක්ෂය මත පදනම් වූ ස්කන්ධ වර්ණාවලීක්ෂ ලක්ෂණ න්‍යායන් විශාල සංඛ්‍යාවක් සකස් කළෙමු. ප්‍රශස්ත ආරක්ෂක (OD) සහ චලනය වන ඉලක්ක (MT) න්‍යායන්හි ප්‍රධාන අනාවැකි පරීක්ෂා කිරීම සඳහා රාමුව. ශාක පරිවෘත්තීය විද්‍යාවේ තොරතුරු සංරචකය OD න්‍යායට අනුකූල වන නමුත් ශාකභක්ෂකයන් නිසා ඇතිවන පරිවෘත්තීය ගතිකය පිළිබඳ MT න්‍යායේ ප්‍රධාන අනාවැකියට පටහැනි වේ. ක්ෂුද්‍ර සිට සාර්ව පරිණාමීය පරිමාණය දක්වා, ජැස්මොනේට් සංඥාව OD හි ප්‍රධාන නිර්ණායකය ලෙස හඳුනාගෙන ඇති අතර, එතිලීන් සංඥාව MS/MS අණුක ජාලය මගින් සටහන් කරන ලද ශාකභක්ෂක-විශේෂිත ප්‍රතිචාරය සියුම් ලෙස සකස් කිරීම සපයන ලදී.
විවිධ ව්‍යුහයන් සහිත විශේෂ පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය, විශේෂයෙන් සතුරන්ගේ ආරක්ෂාව සඳහා, පරිසරයට ශාක අනුවර්තනය වීමේ ප්‍රධාන සහභාගිවන්නන් වේ (1). ශාකවල දක්නට ලැබෙන විශේෂ පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලියේ විශ්මයජනක විවිධාංගීකරණය එහි පාරිසරික ක්‍රියාකාරකම්වල බොහෝ අංශ පිළිබඳ දශක ගණනාවක් පුරා ගැඹුරු පර්යේෂණ උත්තේජනය කර ඇති අතර, ශාක-කෘමි අන්තර්ක්‍රියා වල පරිණාමීය හා පාරිසරික සංවර්ධනය වන ශාක ආරක්ෂක න්‍යායන් පිළිබඳ දිගු ලැයිස්තුවක් නිර්මාණය කර ඇත. ආනුභවික පර්යේෂණ වැදගත් මග පෙන්වීමක් සපයයි (2). කෙසේ වෙතත්, මෙම ශාක ආරක්ෂක න්‍යායන් උපකල්පිත අඩු කිරීමේ තර්කනයේ සම්මත මාර්ගය අනුගමනය නොකළ අතර, එහිදී ප්‍රධාන අනාවැකි එකම මට්ටමේ විශ්ලේෂණ මට්ටමක පැවති අතර (3) සහ න්‍යායික සංවර්ධනයේ ඊළඟ චක්‍රය ඉදිරියට ගෙන යාම සඳහා පර්යේෂණාත්මකව පරීක්ෂා කරන ලදී (4). තාක්ෂණික සීමාවන් දත්ත රැස් කිරීම නිශ්චිත පරිවෘත්තීය කාණ්ඩවලට සීමා කරන අතර විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය පිළිබඳ පුළුල් විශ්ලේෂණය බැහැර කරයි, එමඟින් න්‍යායාත්මක සංවර්ධනය සඳහා අත්‍යවශ්‍ය වන අන්තර්-කාණ්ඩ සංසන්දනයන් වළක්වයි (5). විවිධ ශාක කණ්ඩායම් අතර පරිවෘත්තීය අවකාශයේ සැකසුම් වැඩ ප්‍රවාහය සංසන්දනය කිරීම සඳහා පුළුල් පරිවෘත්තීය දත්ත සහ පොදු මුදල් ඒකකයක් නොමැතිකම ක්ෂේත්‍රයේ විද්‍යාත්මක පරිණතභාවයට බාධා කරයි.
ටැන්ඩම් ස්කන්ධ වර්ණාවලීක්ෂමිතිය (MS/MS) පරිවෘත්තීය ක්ෂේත්‍රයේ නවතම වර්ධනයන් මඟින් දී ඇති පද්ධති ක්ලේඩයක විශේෂ තුළ සහ ඒවා අතර පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් පුළුල් ලෙස සංලක්ෂිත කළ හැකි අතර, මෙම සංකීර්ණ මිශ්‍රණ අතර ව්‍යුහාත්මක සමානතාවය ගණනය කිරීම සඳහා පරිගණක ක්‍රම සමඟ ඒකාබද්ධ කළ හැකිය. රසායන විද්‍යාව පිළිබඳ පූර්ව දැනුම (5). විශ්ලේෂණයේ සහ පරිගණකකරණයේ දියුණු තාක්ෂණයන්හි සංයෝජනය පරිවෘත්තීය විවිධත්වය පිළිබඳ පාරිසරික හා පරිණාමීය න්‍යායන් මගින් කරන ලද බොහෝ අනාවැකි දිගු කාලීනව පරීක්ෂා කිරීම සඳහා අවශ්‍ය රාමුවක් සපයයි. ෂැනන් (6) 1948 දී ඔහුගේ මූලික ලිපියෙන් ප්‍රථම වරට තොරතුරු න්‍යාය හඳුන්වා දුන් අතර, එහි මුල් යෙදුම හැර වෙනත් බොහෝ ක්ෂේත්‍රවල භාවිතා කර ඇති තොරතුරු ගණිතමය විශ්ලේෂණය සඳහා අඩිතාලම දැමීය. ජාන විද්‍යාවේදී, අනුක්‍රමික ගතානුගතික තොරතුරු ප්‍රමාණනය කිරීම සඳහා තොරතුරු න්‍යාය සාර්ථකව යොදා ගෙන ඇත (7). පිටපත් කිරීමේ පර්යේෂණයේදී, තොරතුරු න්‍යාය පිටපත් කිරීමේ සමස්ත වෙනස්කම් විශ්ලේෂණය කරයි (8). පෙර පර්යේෂණ වලදී, ශාකවල පටක මට්ටමේ පරිවෘත්තීය විශේෂඥතාව විස්තර කිරීම සඳහා අපි තොරතුරු න්‍යායේ සංඛ්‍යානමය රාමුව පරිවෘත්තීය විද්‍යාවට යෙදුවෙමු (9). මෙහිදී, ශාකභක්ෂකයන් විසින් ප්‍රේරණය කරන ලද පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලිය පිළිබඳ ශාක ආරක්ෂක න්‍යායේ ප්‍රධාන අනාවැකි සංසන්දනය කිරීම සඳහා, පොදු මුදල් ඒකකයේ පරිවෘත්තීය විවිධත්වය මගින් සංලක්ෂිත තොරතුරු න්‍යායේ සංඛ්‍යානමය රාමුව සමඟ MS/MS මත පදනම් වූ වැඩ ප්‍රවාහය අපි ඒකාබද්ධ කරමු.
ශාක ආරක්ෂණයේ න්‍යායික රාමු සාමාන්‍යයෙන් අන්‍යෝන්‍ය වශයෙන් ඇතුළත් වන අතර කාණ්ඩ දෙකකට බෙදිය හැකිය: ප්‍රශස්ත ආරක්ෂක (OD) (10), චලනය වන ඉලක්කය (MT) (11) වැනි ආරක්ෂක කාර්යයන් මත පදනම්ව ශාක-විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය බෙදා හැරීම පැහැදිලි කිරීමට උත්සාහ කරන ඒවා) සහ පෙනුම (12) න්‍යාය, අනෙක් ඒවා සම්පත් ලබා ගැනීමේ වෙනස්කම් ශාක වර්ධනයට සහ කාබන් වැනි විශේෂිත පරිවෘත්තීය සමුච්චය වීමට බලපාන ආකාරය පිළිබඳ යාන්ත්‍රික පැහැදිලි කිරීම් සොයති: පෝෂක සමතුලිතතා කල්පිතය (13), වර්ධන අනුපාත කල්පිතය (14) සහ වර්ධනය සහ අවකලනය සමතුලිතතා කල්පිතය (15). න්‍යායන් කට්ටල දෙක විශ්ලේෂණ මට්ටම්වල ඇත (4). කෙසේ වෙතත්, ක්‍රියාකාරී මට්ටමින් ආරක්ෂක කාර්යයන් සම්බන්ධ න්‍යායන් දෙකක් ශාක ව්‍යුහාත්මක සහ ප්‍රේරක ආරක්ෂක පිළිබඳ සංවාදයේ ආධිපත්‍යය දරයි: OD න්‍යාය, ශාක අවශ්‍ය විටදී පමණක් ඔවුන්ගේ මිල අධික රසායනික ආරක්ෂක සඳහා ආයෝජනය කරන බව උපකල්පනය කරයි, උදාහරණයක් ලෙස, ඒවා ශරීරගත වූ විට තණකොළ සතෙකු පහර දෙන විට, එබැවින්, අනාගත ප්‍රහාරයේ හැකියාව අනුව, ආරක්ෂක ශ්‍රිතයක් සහිත සංයෝගය පවරනු ලැබේ (10); MT කල්පිතය යෝජනා කරන්නේ දිශානුගත පරිවෘත්තීය වෙනස් වීමේ අක්ෂයක් නොමැති බවයි, නමුත් පරිවෘත්තීය අහඹු ලෙස වෙනස් වන අතර එමඟින් හැකියාව නිර්මාණය වේ. ශාකභක්ෂකයන්ට පහර දීමේ පරිවෘත්තීය "චලන ඉලක්කය" අවහිර කරන්න. වෙනත් වචන වලින් කිවහොත්, මෙම න්‍යායන් දෙක ශාකභක්ෂකයන්ගේ ප්‍රහාරයෙන් පසු සිදුවන පරිවෘත්තීය ප්‍රතිනිර්මාණය පිළිබඳව ප්‍රතිවිරුද්ධ අනාවැකි පළ කරයි: ආරක්ෂක ක්‍රියාකාරිත්වය (OD) සහිත පරිවෘත්තීය ඒක දිශානුගත සමුච්චය වීම සහ සෘජු නොවන පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් (MT) අතර සම්බන්ධතාවය (11).
OD සහ MT උපකල්පනවලට පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලියේ ප්‍රේරිත වෙනස්කම් පමණක් නොව, නිශ්චිත පාරිසරික පරිසරයක මෙම පරිවෘත්තීය වෙනස්කම්වල අනුවර්තන පිරිවැය සහ ප්‍රතිලාභ වැනි මෙම පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය සමුච්චය වීමේ පාරිසරික හා පරිණාමීය ප්‍රතිවිපාක ද ඇතුළත් වේ (16). උපකල්පන දෙකම විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල ආරක්ෂක ක්‍රියාකාරිත්වය හඳුනා ගත්තද, එය මිල අධික විය හැකි හෝ නොවිය හැකි වුවද, OD සහ MT උපකල්පන වෙන්කර හඳුනා ගන්නා ප්‍රධාන පුරෝකථනය ප්‍රේරිත පරිවෘත්තීය වෙනස්කම්වල දිශානතිය තුළ පවතී. OD න්‍යායේ පුරෝකථනයට මෙතෙක් වඩාත්ම පර්යේෂණාත්මක අවධානය ලැබී ඇත. මෙම පරීක්ෂණවලට හරිතාගාර සහ ස්වාභාවික තත්වයන් තුළ නිශ්චිත සංයෝගවල විවිධ පටකවල සෘජු හෝ වක්‍ර ආරක්ෂක කාර්යයන් අධ්‍යයනය කිරීම මෙන්ම ශාක සංවර්ධන අවධියේ වෙනස්කම් ද ඇතුළත් වේ (17-19). කෙසේ වෙතත්, මේ දක්වා, ඕනෑම ජීවියෙකුගේ පරිවෘත්තීය විවිධත්වය පිළිබඳ ගෝලීය පුළුල් විශ්ලේෂණයක් සඳහා වැඩ ප්‍රවාහයක් සහ සංඛ්‍යානමය රාමුවක් නොමැතිකම හේතුවෙන්, න්‍යායන් දෙක අතර ප්‍රධාන වෙනස පුරෝකථනය (එනම්, පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් වල දිශාව) පරීක්ෂා කිරීමට ඉතිරිව ඇත. මෙන්න, අපි එවැනි විශ්ලේෂණයක් සපයන්නෙමු.
ශාක-විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල වඩාත්ම කැපී පෙනෙන ලක්ෂණයක් වන්නේ තනි ශාක, ජනගහනයේ සිට සමාන විශේෂ දක්වා (20) සියලුම මට්ටම්වල ඒවායේ අතිශය ව්‍යුහාත්මක විවිධත්වයයි. විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල බොහෝ ප්‍රමාණාත්මක වෙනස්කම් ජනගහන පරිමාණයෙන් නිරීක්ෂණය කළ හැකි අතර, සාමාන්‍යයෙන් විශේෂ මට්ටමින් ශක්තිමත් ගුණාත්මක වෙනස්කම් පවත්වා ගනී (20). එබැවින්, ශාක පරිවෘත්තීය විවිධත්වය ක්‍රියාකාරී විවිධත්වයේ ප්‍රධාන අංගය වන අතර, එය විවිධ නිකේතනවලට, විශේෂයෙන් විශේෂ කෘමීන් සහ පොදු ශාකභක්ෂකයන් විසින් විවිධ ආක්‍රමණ හැකියාවන් ඇති නිකේතනවලට අනුවර්තනය වීමේ හැකියාව පිළිබිඹු කරයි (21). ශාක-විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල පැවැත්මට හේතු පිළිබඳ ෆ්‍රෙන්කල්ගේ (22) පෙරළිකාර ලිපියේ සිට, විවිධ කෘමීන් සමඟ අන්තර්ක්‍රියා වැදගත් තේරීම් පීඩන ලෙස සලකනු ලබන අතර, මෙම අන්තර්ක්‍රියා පරිණාමය අතරතුර ශාක හැඩගස්වා ඇති බව විශ්වාස කෙරේ. පරිවෘත්තීය මාර්ගය (23). විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල විවිධත්වයේ අන්තර් විශේෂ වෙනස්කම්, ශාකභක්ෂක උපාය මාර්ගවලට එරෙහිව ව්‍යුහාත්මක සහ ප්‍රේරණය කළ හැකි ශාක ආරක්ෂාව හා සම්බන්ධ භෞතික විද්‍යාත්මක සමතුලිතතාවය ද පිළිබිඹු කළ හැකිය, මන්ද විශේෂ දෙක බොහෝ විට එකිනෙකා සමඟ සෘණාත්මකව සහසම්බන්ධ වේ (24). සෑම විටම හොඳ ආරක්ෂාවක් පවත්වා ගැනීම ප්‍රයෝජනවත් විය හැකි වුවද, ආරක්ෂාව හා සම්බන්ධ කාලෝචිත පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් ශාකවලට අනෙකුත් භෞතික විද්‍යාත්මක ආයෝජන සඳහා වටිනා සම්පත් වෙන් කිරීමට ඉඩ සලසන පැහැදිලි ප්‍රතිලාභ ලබා දෙයි (19, 24), සහ සහජීවනයේ අවශ්‍යතාවය වළක්වා ගන්න. සම පාර්ශවීය හානි (25). ඊට අමතරව, කෘමි ශාකභක්ෂකයන් නිසා ඇති වන විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය ප්‍රතිසංවිධානය කිරීම ජනගහනයේ විනාශකාරී ව්‍යාප්තියට හේතු විය හැක (26), සහ ජනගහනයේ පවත්වා ගත හැකි ජැස්මොනික් අම්ල (JA) සංඥාවේ සැලකිය යුතු ස්වාභාවික වෙනස්කම් පිළිබඳ සෘජු කියවීම් පිළිබිඹු කළ හැකිය. ඉහළ සහ අඩු JA සංඥා යනු ශාකභක්ෂකයන්ට එරෙහිව ආරක්ෂාව සහ නිශ්චිත විශේෂ සමඟ තරඟකාරිත්වය අතර හුවමාරුවකි (27). ඊට අමතරව, විශේෂිත පරිවෘත්තීය ජෛව සංස්ලේෂක මාර්ග පරිණාමය අතරතුර වේගවත් අලාභයකට සහ පරිවර්තනයකට භාජනය වන අතර, එහි ප්‍රතිඵලයක් ලෙස සමීපව සම්බන්ධ විශේෂ අතර පැල්ලම් සහිත පරිවෘත්තීය ව්‍යාප්තියක් ඇති වේ (28). වෙනස් වන ශාකභක්ෂක රටා වලට ප්‍රතිචාර වශයෙන් මෙම බහුරූපතාවන් වේගයෙන් ස්ථාපිත කළ හැකිය (29), එයින් අදහස් කරන්නේ ශාකභක්ෂක ප්‍රජාවන්ගේ උච්චාවචනය පරිවෘත්තීය විෂමජාතීයතාවයට හේතු වන ප්‍රධාන සාධකයක් බවයි.
මෙහිදී, අපි විශේෂයෙන් පහත ගැටළු විසඳා ගත්තෙමු. (I) ශාකභක්ෂක කෘමියා ශාක පරිවෘත්තීය නැවත සකස් කරන්නේ කෙසේද? (Ii) දිගුකාලීන ආරක්ෂක න්‍යායේ අනාවැකි පරීක්ෂා කිරීම සඳහා ප්‍රමාණනය කළ හැකි පරිවෘත්තීය ප්ලාස්ටික් බවේ ප්‍රධාන තොරතුරු සංරචක මොනවාද? (Iii) ප්‍රහාරකයාට අනන්‍ය වූ ආකාරයකින් ශාක පරිවෘත්තීය නැවත වැඩසටහන්ගත කළ යුතුද, එසේ නම්, නිශ්චිත පරිවෘත්තීය ප්‍රතිචාරයක් සකස් කිරීමේදී ශාක හෝමෝනය ඉටු කරන කාර්යභාරය කුමක්ද, සහ ආරක්ෂාවේ විශේෂ විශේෂත්වයට දායක වන පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය මොනවාද? (Iv) බොහෝ ආරක්ෂක න්‍යායන් මගින් කරන ලද අනාවැකි ජීව විද්‍යාත්මක පටකවල සියලුම මට්ටම් හරහා ව්‍යාප්ත කළ හැකි බැවින්, අභ්‍යන්තර සංසන්දනයේ සිට අන්තර් විශේෂ සංසන්දනය දක්වා ඇති වන පරිවෘත්තීය ප්‍රතිචාරය කෙතරම් අනුකූලදැයි අපි විමසුවෙමු. මේ සඳහා, අපි දුම්කොළ නිකොටින් වල කොළ පරිවෘත්තීය ක්‍රමානුකූලව අධ්‍යයනය කර ඇති අතර එය පොහොසත් විශේෂිත පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලියක් සහිත පාරිසරික ආදර්ශ ශාකයක් වන අතර දේශීය ශාකභක්ෂකයන් දෙදෙනෙකු වන ලෙපිඩොප්ටෙරා ඩටුරා (Ms) (ඉතා ආක්‍රමණශීලී, ප්‍රධාන වශයෙන් අනුභව කරනු ලැබේ) ගේ කීටයන්ට එරෙහිව ඵලදායී වේ. සොලනේසී සහ ස්පොඩොප්ටෙරා ලිටෝරලිස් (Sl) මත, කපු කොළ පණුවන් යනු සොලනේසී හි ධාරක ශාක සහ අනෙකුත් කුල සහ පවුල්වල අනෙකුත් ධාරක සහිත "කුලයක්" වන අතර ශාක ආහාර වේ. අපි MS/MS පරිවෘත්තීය වර්ණාවලිය විග්‍රහ කර OD සහ MT න්‍යායන් සංසන්දනය කිරීම සඳහා තොරතුරු න්‍යාය සංඛ්‍යානමය විස්තර උපුටා ගත්තෙමු. ප්‍රධාන පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල අනන්‍යතාවය හෙළි කිරීමට නිශ්චිතතා සිතියම් සාදන්න. ශාක හෝමෝන සංඥා කිරීම සහ OD ප්‍රේරණය අතර සහවිචලනය තවදුරටත් විශ්ලේෂණය කිරීම සඳහා විශ්ලේෂණය N. nasi හි දේශීය ජනගහනය සහ සමීපව සම්බන්ධ දුම්කොළ විශේෂ දක්වා ව්‍යාප්ත කරන ලදී.
ශාකභක්ෂක දුම්කොළවල පත්‍ර පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යයේ ප්ලාස්ටික් බව සහ ව්‍යුහය පිළිබඳ සමස්ත සිතියමක් ග්‍රහණය කර ගැනීම සඳහා, ශාක සාරය (9) වලින් අධි-විභේදන දත්ත ස්වාධීන MS/MS වර්ණාවලි පුළුල් ලෙස එකතු කර විසංයෝජනය කිරීම සඳහා අපි කලින් සංවර්ධනය කරන ලද විශ්ලේෂණයක් සහ ගණනය කිරීමේ වැඩ ප්‍රවාහයක් භාවිතා කළෙමු. මෙම වෙනස් නොකළ ක්‍රමය (MS/MS ලෙස හැඳින්වේ) අතිරික්ත නොවන සංයෝග වර්ණාවලි ගොඩනගා ගත හැකි අතර, එය මෙහි විස්තර කර ඇති සියලුම සංයෝග මට්ටමේ විශ්ලේෂණයන් සඳහා භාවිතා කළ හැකිය. මෙම විසංයෝජනය කරන ලද ශාක පරිවෘත්තීය විවිධ වර්ගවල වන අතර, පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය සිය ගණනක් සිට දහස් ගණනක් දක්වා (මෙහි 500-1000-s/MS/MS පමණ) සමන්විත වේ. මෙහිදී, අපි තොරතුරු න්‍යායේ රාමුව තුළ පරිවෘත්තීය ප්ලාස්ටික් බව සලකා බලන අතර, පරිවෘත්තීය සංඛ්‍යාත ව්‍යාප්තියේ ෂැනන් එන්ට්‍රොපිය මත පදනම්ව පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යයේ විවිධත්වය සහ වෘත්තීයභාවය ප්‍රමාණනය කරමු. කලින් ක්‍රියාත්මක කරන ලද සූත්‍රය (8) භාවිතා කරමින්, පරිවෘත්තීය විවිධත්වය (Hj දර්ශකය), පරිවෘත්තීය පැතිකඩ විශේෂීකරණය (δj දර්ශකය) සහ තනි පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යයක (Si දර්ශකය) පරිවෘත්තීය නිශ්චිතතාව ප්‍රමාණනය කිරීමට භාවිතා කළ හැකි දර්ශක සමූහයක් අපි ගණනය කළෙමු. ඊට අමතරව, ශාකභක්ෂකයන්ගේ පරිවෘත්තීය ප්‍රේරණය ප්‍රමාණනය කිරීම සඳහා අපි සාපේක්ෂ දුර ප්ලාස්ටික්තා දර්ශකය (RDPI) යෙදුවෙමු (රූපය 1A) (30). මෙම සංඛ්‍යානමය රාමුව තුළ, අපි MS/MS වර්ණාවලිය මූලික තොරතුරු ඒකකය ලෙස සලකන අතර, MS/MS හි සාපේක්ෂ බහුලත්වය සංඛ්‍යාත බෙදාහැරීමේ සිතියමකට සකසමු, ඉන්පසු එයින් පරිවෘත්තීය විවිධත්වය ඇස්තමේන්තු කිරීමට ෂැනන් එන්ට්‍රොපිය භාවිතා කරමු. පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණය තනි MS/MS වර්ණාවලියක සාමාන්‍ය නිශ්චිතතාව මගින් මනිනු ලැබේ. එබැවින්, ශාකභක්ෂක ප්‍රේරණයෙන් පසු සමහර MS/MS පන්තිවල බහුලත්වය වැඩිවීම වර්ණාවලි ප්‍රේරණය, RDPI සහ විශේෂීකරණය බවට පරිවර්තනය වේ, එනම්, δj දර්ශකයේ වැඩි වීම, මන්ද වඩාත් විශේෂිත පරිවෘත්තීය නිපදවන අතර ඉහළ Si දර්ශකයක් නිපදවන බැවිනි. Hj විවිධත්ව දර්ශකය අඩු කිරීමෙන් පිළිබිඹු වන්නේ ජනනය කරන ලද MS/MS ගණන අඩු වන බවයි, නැතහොත් පැතිකඩ සංඛ්‍යාත ව්‍යාප්තිය අඩු ඒකාකාර දිශාවකට වෙනස් වන අතර එහි සමස්ත අවිනිශ්චිතතාවය අඩු කරයි. Si දර්ශක ගණනය කිරීම හරහා, ඇතැම් ශාකභක්ෂකයන් විසින් ප්‍රේරණය කරනු ලබන MS/MS මොනවාද යන්න ඉස්මතු කළ හැකි අතර, ඊට ප්‍රතිවිරුද්ධව, MT සහ OD පුරෝකථනය වෙන්කර හඳුනා ගැනීමට ප්‍රධාන දර්ශකයක් වන ප්‍රේරණයට ප්‍රතිචාර නොදක්වන MS/MS මොනවාද යන්න ඉස්මතු කළ හැකිය.
(A) ශාකභක්ෂක (H1 සිට Hx දක්වා) MS/MS දත්ත-ප්‍රේරණය (RDPI), විවිධත්වය (Hj දර්ශකය), විශේෂීකරණය (δj දර්ශකය) සහ පරිවෘත්තීය නිශ්චිතතාව (Si දර්ශකය) සඳහා භාවිතා කරන සංඛ්‍යානමය විස්තර කරන්නන්. විශේෂීකරණය (δj) මට්ටම වැඩි වීමෙන් පෙන්නුම් කරන්නේ, සාමාන්‍යයෙන්, වැඩි ශාකභක්ෂක නිශ්චිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය නිපදවනු ඇති බවයි, විවිධත්වයේ අඩුවීමක් (Hj) පෙන්නුම් කරන්නේ පරිවෘත්තීය නිෂ්පාදනයේ අඩුවීමක් හෝ බෙදාහැරීමේ සිතියමේ පරිවෘත්තීය අසමාන ව්‍යාප්තියක් බවයි. Si අගය මගින් පරිවෘත්තීය ලබා දී ඇති තත්වයකට (මෙහි, ශාකභක්ෂක) විශේෂිතද නැතහොත් අනෙක් අතට එකම මට්ටමක පවත්වා ගෙන යනු ලබන්නේද යන්න තක්සේරු කරයි. (B) තොරතුරු න්‍යාය අක්ෂය භාවිතා කරමින් ආරක්ෂක න්‍යාය පුරෝකථනයේ සංකල්පීය රූප සටහන. ශාකභක්ෂක ප්‍රහාරය ආරක්ෂක පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය වැඩි කරන බවත්, එමඟින් δj වැඩි වන බවත් OD න්‍යාය පුරෝකථනය කරයි. ඒ සමඟම, පරිවෘත්තීය තොරතුරු වල අඩු අවිනිශ්චිතතාවය දෙසට පැතිකඩ ප්‍රතිසංවිධානය කර ඇති බැවින් Hj අඩු වේ. ශාකභක්ෂකයන්ගේ ප්‍රහාරය පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලියේ දිශානුගත නොවන වෙනස්කම් ඇති කරන බවත්, එමඟින් පරිවෘත්තීය තොරතුරු අවිනිශ්චිතතාවයේ දර්ශකයක් ලෙස Hj වැඩි කරන බවත් Si හි අහඹු ව්‍යාප්තියක් ඇති කරන බවත් MT න්‍යාය පුරෝකථනය කරයි. ඉහළ ආරක්ෂක අගයන් සහිත සමහර පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය විශේෂයෙන් වැඩි වන (ඉහළ Si අගය) සහ අනෙක් ඒවා අහඹු ප්‍රතිචාර (පහළ Si අගය) පෙන්වන හොඳම MT මිශ්‍ර ආකෘතියක් ද අපි යෝජනා කළෙමු.
තොරතුරු න්‍යාය විස්තර කරන්නන් භාවිතා කරමින්, ප්‍රේරිත නොවන ව්‍යුහාත්මක තත්වයක ශාකභක්ෂක-ප්‍රේරිත විශේෂ පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් (i) පරිවෘත්තීය නිශ්චිතතාවයේ (Si දර්ශකය) වැඩි වීමකට (δj දර්ශකය) පරිවෘත්තීය නිශ්චිතතාව මෙහෙයවීම (δj දර්ශකය) වැඩි වීමට සහ (ii) වැඩි ලෙප්ටින් ශරීර ව්‍යාප්තියකට පරිවෘත්තීය සංඛ්‍යාත ව්‍යාප්තිය වෙනස් වීම හේතුවෙන් පරිවෘත්තීය විවිධත්වයේ (Hj දර්ශකය) අඩුවීමට හේතු වන බව පුරෝකථනය කිරීමට අපි OD න්‍යාය අර්ථකථනය කරමු. තනි පරිවෘත්තීය මට්ටමින්, ඇණවුම් කළ Si ව්‍යාප්තියක් අපේක්ෂා කෙරේ, එහිදී පරිවෘත්තීය එහි ආරක්ෂක අගය අනුව Si අගය වැඩි කරයි (රූපය 1B). මෙම රේඛාව ඔස්සේ, උද්දීපනය (i) δj දර්ශකයේ අඩුවීමක් ඇති කරන පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල දිශානුගත නොවන වෙනස්කම් සහ (ii) පරිවෘත්තීය අවිනිශ්චිතතාවයේ වැඩි වීමක් හේතුවෙන් Hj දර්ශකයේ වැඩි වීමක් ඇති කරන බව පුරෝකථනය කිරීමට අපි MT න්‍යාය පැහැදිලි කරමු. නැතහොත් සාමාන්‍යකරණය කළ විවිධත්වයේ ස්වරූපයෙන් ෂැනන් එන්ට්‍රොපිය මගින් ප්‍රමාණනය කළ හැකිය. පරිවෘත්තීය සංයුතිය සම්බන්ධයෙන් ගත් කල, MT න්‍යාය Si හි අහඹු ව්‍යාප්තිය පුරෝකථනය කරනු ඇත. ඇතැම් පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය නිශ්චිත තත්වයන් යටතේ නිශ්චිත තත්වයන් යටතේ පවතින බවත්, අනෙකුත් තත්වයන් නිශ්චිත තත්වයන් යටතේ නොමැති බවත්, ඒවායේ ආරක්ෂක අගය පරිසරය මත රඳා පවතින බවත් සැලකිල්ලට ගනිමින්, අපි මිශ්‍ර ආරක්ෂක ආකෘතියක් ද යෝජනා කළෙමු, එහිදී δj සහ Hj Si වැඩිවීම ඔස්සේ සෑම දිශාවකටම දෙකට බෙදා හරිනු ලැබේ, ඉහළ ආරක්ෂක අගයන් ඇති ඇතැම් පරිවෘත්තීය කණ්ඩායම් පමණක් විශේෂයෙන් Si වැඩි කරන අතර අනෙක් ඒවාට අහඹු ව්‍යාප්තියක් ඇත (රූපය 1B).
තොරතුරු න්‍යාය විස්තරයේ අක්ෂය මත නැවත අර්ථ දක්වා ඇති ආරක්ෂක න්‍යාය අනාවැකිය පරීක්ෂා කිරීම සඳහා, අපි නෙපෙන්තස් පැලන්ස් කොළ මත විශේෂඥ (Ms) හෝ සාමාන්‍ය (Sl) ශාකභක්ෂක කීටයන් ඇති කළෙමු (රූපය 2A). MS/MS විශ්ලේෂණය භාවිතා කරමින්, දළඹුවන් පෝෂණය කිරීමෙන් පසු එකතු කරන ලද පත්‍ර පටක වල මෙතනෝල් සාරය වලින් අපි අතිරික්ත නොවන MS/MS වර්ණාවලි (දත්ත ගොනුව S1) 599 ක් ලබා ගත්තෙමු. MS/MS වින්‍යාස ගොනු වල තොරතුරු අන්තර්ගතය නැවත වින්‍යාස කිරීම දෘශ්‍යමාන කිරීම සඳහා RDPI, Hj සහ δj දර්ශක භාවිතා කිරීමෙන් සිත්ගන්නා රටා අනාවරණය වේ (රූපය 2B). සමස්ත ප්‍රවණතාවය නම්, තොරතුරු විස්තරකය මගින් විස්තර කර ඇති පරිදි, දළඹුවන් කොළ අනුභව කිරීම දිගටම කරගෙන යන විට, කාලයත් සමඟ සියලුම පරිවෘත්තීය ප්‍රතිසංවිධානයේ මට්ටම වැඩි වීමයි: ශාකභක්ෂකයා ආහාරයට ගැනීමෙන් පැය 72 කට පසු, RDPI සැලකිය යුතු ලෙස වැඩි වේ. හානියට පත් නොවූ පාලනය සමඟ සසඳන විට, Hj සැලකිය යුතු ලෙස අඩු විය, එය δj දර්ශකය මගින් ප්‍රමාණනය කරන ලද පරිවෘත්තීය පැතිකඩෙහි විශේෂීකරණයේ මට්ටම වැඩි වීම නිසා විය. මෙම පෙනෙන ප්‍රවණතාවය OD න්‍යායේ අනාවැකි සමඟ අනුකූල වන නමුත් MT න්‍යායේ ප්‍රධාන අනාවැකි සමඟ නොගැලපේ, එය විශ්වාස කරන්නේ පරිවෘත්තීය මට්ටම්වල අහඹු (දිශානුගත නොවන) වෙනස්කම් ආරක්ෂක සැඟවීමක් ලෙස භාවිතා කරන බවයි (රූපය 1B). මෙම ශාකභක්ෂකයන් දෙදෙනාගේ මුඛ ස්‍රාවය (OS) ප්‍රේරක අන්තර්ගතය සහ පෝෂණ හැසිරීම වෙනස් වුවද, ඔවුන්ගේ සෘජු පෝෂණය පැය 24 සහ පැය 72 අස්වැන්න නෙළන කාලවලදී Hj සහ δj දිශාවන්හි සමාන වෙනස්කම් ඇති කළේය. RDPI හි පැය 72 දී පමණක් වෙනස සිදු විය. Ms පෝෂණය කිරීමෙන් ඇති වූ දෙයට සාපේක්ෂව, Sl පෝෂණය මගින් ඇති කරන ලද සමස්ත පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලිය වැඩි විය.
(A) පර්යේෂණාත්මක නිර්මාණය: සාමාන්‍ය ඌරු (S1) හෝ විශේෂඥ (Ms) ශාකභක්ෂකයන්ට පිචර් ශාකවල ලවණ ඉවත් කළ කොළ පෝෂණය කරනු ලබන අතර, අනුකරණය කරන ලද ශාකභක්ෂක සඳහා, සම්මත පත්‍ර ස්ථාන තුවාලයේ සිදුරු කිරීම සඳහා Ms (W + OSMs) හි OS භාවිතා වේ. S1 (W + OSSl) කීටයන් හෝ ජලය (W + W). පාලනය (C) යනු හානියට පත් නොවූ පත්‍රයකි. (B) ප්‍රේරකතාව (පාලන ප්‍රස්ථාරය සමඟ සසඳන විට RDPI), විවිධත්වය (Hj දර්ශකය) සහ විශේෂ පරිවෘත්තීය සිතියම සඳහා ගණනය කරන ලද විශේෂීකරණය (δj දර්ශකය) දර්ශකය (599 MS/MS; දත්ත ගොනුව S1). තරු ලකුණු සෘජු ශාකභක්ෂක පෝෂණය සහ පාලන කණ්ඩායම අතර සැලකිය යුතු වෙනස්කම් දක්වයි (යුගලනය කළ t-පරීක්ෂණය සමඟ ශිෂ්‍යයාගේ t-පරීක්ෂණය, *P<0.05 සහ ***P<0.001). ns, වැදගත් නොවේ. (C) අනුකරණය කරන ලද ශාකභක්ෂක ප්‍රතිකාරයෙන් පසු ප්‍රධාන (නිල් පෙට්ටිය, ඇමයිනෝ අම්ලය, කාබනික අම්ලය සහ සීනි; දත්ත ගොනුව S2) සහ විශේෂ පරිවෘත්තීය වර්ණාවලියේ (රතු කොටුව 443 MS/MS; දත්ත ගොනුව S1) කාල විභේදන දර්ශකය. වර්ණ පටිය 95% විශ්වාසනීය පරතරයට යොමු කරයි. තරු ලකුණ ප්‍රතිකාරය සහ පාලනය අතර සැලකිය යුතු වෙනස දක්වයි [චතුර්තික විචල්‍යතා විශ්ලේෂණය (ANOVA), පසුව ටුකීගේ අවංකවම සැලකිය යුතු වෙනස (HSD) පශ්චාත් කාලීන බහු සංසන්දනයන් සඳහා, *P<0.05, **P<0.01 සහ *** P <0.001]. (D) විසිරුම් බිම් කොටස් සහ විශේෂ පරිවෘත්තීය පැතිකඩවල විශේෂීකරණය (විවිධ ප්‍රතිකාර සමඟ නැවත නැවත සාම්පල).
පරිවෘත්තීය මට්ටමින් ශාකභක්ෂක-ප්‍රේරිත ප්‍රතිනිර්මාණය තනි පරිවෘත්තීය මට්ටමේ වෙනස්කම් වලින් පිළිබිඹු වේද යන්න ගවේෂණය කිරීම සඳහා, අපි මුලින්ම අවධානය යොමු කළේ නෙපෙන්තස් පැලන් වල කොළ වල කලින් අධ්‍යයනය කරන ලද ඔප්පු කරන ලද ශාකභක්ෂක ප්‍රතිරෝධයක් සහිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය කෙරෙහි ය. ෆීනොලික් ඇමයිඩ යනු කෘමීන්ගේ ශාකභක්ෂක ක්‍රියාවලියේදී එකතු වන හයිඩ්‍රොක්සිසිනමයිඩ්-පොලියමයින් සංයෝජක වන අතර ඒවා කෘමි ක්‍රියාකාරිත්වය අඩු කරන බව දන්නා කරුණකි (32). අපි අනුරූප MS/MS හි පූර්වගාමීන් සෙවූ අතර ඒවායේ සමුච්චිත චාලක වක්‍ර සැලසුම් කළෙමු (රූපය S1). පුදුමයට කරුණක් නොවේ, ක්ලෝරොජනික් අම්ලය (CGA) සහ රූටින් වැනි ශාකභක්ෂකයන්ට එරෙහිව ආරක්ෂාවට සෘජුවම සම්බන්ධ නොවන ෆීනෝල් ​​ව්‍යුත්පන්නයන් ශාකභක්ෂකයෙන් පසු පහළට නියාමනය කරනු ලැබේ. ඊට වෙනස්ව, ශාකභක්ෂකයන්ට ෆීනෝල් ​​ඇමයිඩ ඉතා බලවත් කළ හැකිය. ශාකභක්ෂකයන් දෙදෙනාගේ අඛණ්ඩ පෝෂණය ෆීනෝලමයිඩ් වල එකම උද්දීපන වර්ණාවලියට හේතු වූ අතර, මෙම රටාව ෆීනෝලමයිඩ් වල නව සංස්ලේෂණය සඳහා විශේෂයෙන් පැහැදිලි විය. ඵලදායී ශාකභක්ෂක විරෝධී ක්‍රියාකාරකම් සහිත ඇසික්ලික් ඩයිටර්පීන් විශාල සංඛ්‍යාවක් නිපදවන 17-හයිඩ්‍රොක්සිජෙරනයිල් නොනඩියොල් ඩයිටර්පීන් ග්ලයිකෝසයිඩ් (17-HGL-DTGs) මාර්ගය ගවේෂණය කිරීමේදී ද එම සංසිද්ධියම නිරීක්ෂණය වනු ඇත (33), එයින් Ms Feeding with Sl සමාන ප්‍රකාශන පැතිකඩක් අවුලුවා ඇත (රූපය S1)).
සෘජු ශාකභක්ෂක ආහාර අත්හදා බැලීම්වල ඇති විය හැකි අවාසිය නම් ශාකභක්ෂකයන්ගේ කොළ පරිභෝජන අනුපාතයේ සහ ආහාර ගැනීමේ කාලයේ වෙනස වන අතර එමඟින් තුවාල සහ ශාකභක්ෂකයන් නිසා ඇති වන ශාකභක්ෂක-විශේෂිත බලපෑම් ඉවත් කිරීම දුෂ්කර වේ. ප්‍රේරිත පත්‍ර පරිවෘත්තීය ප්‍රතිචාරයේ ශාකභක්ෂක විශේෂ විශේෂත්වය වඩා හොඳින් විසඳීම සඳහා, අපි නැවුම්ව එකතු කරන ලද OS (OSM සහ OSS1) ස්ථාවර පත්‍ර ස්ථානවල සම්මත සිදුරු W වෙත වහාම යෙදීමෙන් Ms සහ Sl කීටයන් පෝෂණය කිරීම අනුකරණය කළෙමු. මෙම ක්‍රියා පටිපාටිය W + OS ප්‍රතිකාරය ලෙස හඳුන්වන අතර, එය පටක අලාභයේ අනුපාතයේ හෝ ප්‍රමාණයේ වෙනස්කම්වල ව්‍යාකූල බලපෑම් ඇති නොකර ශාකභක්ෂකයා විසින් ඇති කරන ලද ප්‍රතිචාරයේ ආරම්භය නිශ්චිතව කාලානුරූපව නියම කිරීමෙන් ප්‍රේරණය ප්‍රමිතිකරණය කරයි (රූපය 2A) (34). MS/MS විශ්ලේෂණය සහ ගණනය කිරීමේ නල මාර්ගය භාවිතා කරමින්, අපි සෘජු ආහාර අත්හදා බැලීම් වලින් කලින් එකලස් කරන ලද වර්ණාවලි සමඟ අතිච්ඡාදනය වූ MS/MS වර්ණාවලි 443 (දත්ත ගොනුව S1) ලබා ගත්තෙමු. මෙම MS/MS දත්ත කට්ටලයේ තොරතුරු න්‍යාය විශ්ලේෂණයෙන් පෙන්නුම් කළේ ශාකභක්ෂකයන් අනුකරණය කිරීමෙන් කොළ-විශේෂිත පරිවෘත්තීය නැවත ක්‍රමලේඛනය කිරීම OS-විශේෂිත ප්‍රේරණ පෙන්නුම් කළ බවයි (රූපය 2C). විශේෂයෙන්, OSS1 ප්‍රතිකාරය හා සසඳන විට, OSM පැය 4 කින් පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණයේ වැඩි දියුණුවක් ඇති කළේය. සෘජු ශාකභක්ෂක ආහාර පර්යේෂණාත්මක දත්ත කට්ටලය හා සසඳන විට, Hj සහ δj ඛණ්ඩාංක ලෙස ද්විමාන අවකාශයේ දෘශ්‍යමාන කරන ලද පරිවෘත්තීය චාලක විද්‍යාව සහ කාලයත් සමඟ අනුකරණය කරන ලද ශාකභක්ෂක ප්‍රතිකාරයට ප්‍රතිචාර වශයෙන් පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණයේ දිශානතිය අනුකූලතාව වැඩි කිරීම (රූපය 2D). ඒ සමඟම, පරිවෘත්තීය විශේෂඥතාවයේ මෙම ඉලක්කගත වැඩිවීම අනුකරණය කරන ලද ශාකභක්ෂකයන්ට ප්‍රතිචාර වශයෙන් මධ්‍යම කාබන් පරිවෘත්තීය නැවත වින්‍යාස කිරීම නිසා සිදු වේද යන්න විමර්ශනය කිරීම සඳහා අපි ඇමයිනෝ අම්ල, කාබනික අම්ල සහ සීනි (දත්ත ගොනුව S2) වල අන්තර්ගතය ප්‍රමාණනය කළෙමු (රූපය S2). මෙම රටාව වඩා හොඳින් පැහැදිලි කිරීම සඳහා, කලින් සාකච්ඡා කළ ෆීනෝලමයිඩ් සහ 17-HGL-DTG මාර්ගවල පරිවෘත්තීය සමුච්චය චාලක විද්‍යාව අපි තවදුරටත් නිරීක්ෂණය කළෙමු. ශාකභක්ෂකයන්ගේ OS-විශේෂිත ප්‍රේරණය ෆීනෝලමයිඩ් පරිවෘත්තීය තුළ අවකල්‍ය ප්‍රතිසංවිධාන රටාවක් බවට පරිවර්තනය වේ (රූපය S3). කූමරින් සහ කැෆියොයිල් කොටස් අඩංගු ෆීනොලික් ඇමයිඩ OSS1 මගින් ප්‍රේරණය කරනු ලබන අතර, OSMs ෆෙරුලයිල් සංයුජවල නිශ්චිත ප්‍රේරණයක් අවුලුවනු ලැබේ. 17-HGL-DTG මාර්ගය සඳහා, පහළ මැලෝනිලේෂන් සහ ඩයිමෙලෝනිලේෂන් නිෂ්පාදන මගින් අවකල OS ප්‍රේරණය අනාවරණය විය (රූපය S3).
ඊළඟට, ශාක භක්ෂකයන් තුළ රොසෙටා ශාක පත්‍රවල කොළ වලට ප්‍රතිකාර කිරීම සඳහා OSM භාවිතය අනුකරණය කරන කාල-පාඨමාලා ක්ෂුද්‍ර අරා දත්ත කට්ටලය භාවිතා කරමින් අපි OS-ප්‍රේරිත පිටපත් කිරීමේ ප්ලාස්ටික් බව අධ්‍යයනය කළෙමු. නියැදි චාලක විද්‍යාව මූලික වශයෙන් මෙම පරිවෘත්තීය අධ්‍යයනයේ භාවිතා කරන චාලක විද්‍යාව සමඟ අතිච්ඡාදනය වේ (35). කාලයත් සමඟ පරිවෘත්තීය ප්ලාස්ටික් බව විශේෂයෙන් වැඩි වන පරිවෘත්තීය නැවත වින්‍යාස කිරීම සමඟ සසඳන විට, Ms විසින් ප්‍රේරිත කරන ලද කොළවල අස්ථිර පිටපත් කිරීමේ පිපිරීම් අපි නිරීක්ෂණය කරමු, එහිදී පිටපත් කිරීමේ ප්‍රේරකතාව (RDPI) සහ විශේෂීකරණය (δj) 1 වේ. පැය ගණනෙහි සැලකිය යුතු වැඩි වීමක් සිදු වූ අතර, විවිධත්වය (Hj) මෙම අවස්ථාවේදී, BMP1 හි ප්‍රකාශනය සැලකිය යුතු ලෙස අඩු වූ අතර, පසුව පිටපත් කිරීමේ විශේෂීකරණය ලිහිල් කිරීම (රූපය S4). පරිවෘත්තීය ජාන පවුල් (P450, ග්ලයිකොසයිල්ට්‍රාන්ස්ෆරේස් සහ BAHD ඇසිල්ට්‍රාන්ස්ෆරේස් වැනි) ඉහත සඳහන් කළ මුල් අධි-විශේෂීකරණ ආකෘතිය අනුගමනය කරමින් ප්‍රාථමික පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලියෙන් ලබාගත් ව්‍යුහාත්මක ඒකක වලින් විශේෂ පරිවෘත්තීය එකලස් කිරීමේ ක්‍රියාවලියට සහභාගී වේ. සිද්ධි අධ්‍යයනයක් ලෙස, ෆීනයිලලනීන් මාර්ගය විශ්ලේෂණය කරන ලදී. විශ්ලේෂණයෙන් තහවුරු වූයේ ෆීනොලමයිඩ් පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලියේ මූලික ජාන, ආකර්ෂණය නොවූ ශාක හා සසඳන විට ශාකභක්ෂකයන් තුළ ඉතා OS-ප්‍රේරිත බවත්, ඒවායේ ප්‍රකාශන රටා තුළ සමීපව පෙළ ගැසී ඇති බවත්ය. මෙම මාර්ගයේ ඉහළට ඇති පිටපත් කිරීමේ සාධකය MYB8 සහ ව්‍යුහාත්මක ජාන PAL1, PAL2, C4H සහ 4CL පිටපත් කිරීමේ මුල් ආරම්භය පෙන්නුම් කළේය. AT1, DH29 සහ CV86 වැනි ෆීනොලමයිඩ් වල අවසාන එකලස් කිරීමේදී භූමිකාවක් ඉටු කරන ඇසිල්ට්‍රාන්ස්ෆෙරේස්, දිගුකාලීන ඉහළ යාමේ රටාවක් පෙන්නුම් කරයි (රූපය S4). ඉහත නිරීක්ෂණවලින් පෙනී යන්නේ පිටපත් කිරීමේ විශේෂීකරණයේ මුල් ආරම්භය සහ පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණයේ පසුකාලීන වැඩිදියුණු කිරීම යුගල මාදිලියක් වන අතර එය බලගතු ආරක්ෂක ප්‍රතිචාරයක් ආරම්භ කරන සමමුහුර්ත නියාමන පද්ධතිය නිසා විය හැකි බවයි.
ශාක හෝමෝන සංඥාකරණයේ නැවත වින්‍යාසය ශාකවල කායික විද්‍යාව නැවත වැඩසටහන්ගත කිරීම සඳහා ශාකභක්ෂක තොරතුරු ඒකාබද්ධ කරන නියාමන ස්ථරයක් ලෙස ක්‍රියා කරයි. ශාකභක්ෂක අනුකරණයෙන් පසුව, අපි ප්‍රධාන ශාක හෝමෝන කාණ්ඩවල සමුච්චිත ගතිකත්වය මනින ලද අතර ඒවා අතර තාවකාලික සහ-ප්‍රකාශනය දෘශ්‍යමාන කළෙමු [පියර්සන් සහසම්බන්ධතා සංගුණකය (PCC)> 0.4] (රූපය 3A). අපේක්ෂා කළ පරිදි, ජෛව සංස්ලේෂණයට අදාළ ශාක හෝමෝන ශාක හෝමෝන සහ-ප්‍රකාශන ජාලය තුළ සම්බන්ධ වේ. ඊට අමතරව, විවිධ ප්‍රතිකාර මගින් ප්‍රේරණය වන ශාක හෝමෝන ඉස්මතු කිරීම සඳහා පරිවෘත්තීය නිශ්චිතතාව (Si දර්ශකය) මෙම ජාලයට සිතියම්ගත කර ඇත. ශාකභක්ෂක නිශ්චිත ප්‍රතිචාරයේ ප්‍රධාන ක්ෂේත්‍ර දෙකක් ඇද ගනු ලැබේ: එකක් JA පොකුරේ වන අතර, එහිදී JA (එහි ජීව විද්‍යාත්මකව ක්‍රියාකාරී ස්වරූපය JA-Ile) සහ අනෙකුත් JA ව්‍යුත්පන්නයන් ඉහළම Si ලකුණු පෙන්වයි; අනෙක එතිලීන් (ET) වේ. ගිබෙරෙලින් ශාකභක්ෂක නිශ්චිතතාවයේ මධ්‍යස්ථ වැඩිවීමක් පමණක් පෙන්නුම් කළ අතර, සයිටොකිනින්, ඔක්සින් සහ අබ්සිසික් අම්ලය වැනි අනෙකුත් ශාක හෝමෝන ශාකභක්ෂකයන් සඳහා අඩු ප්‍රේරක නිශ්චිතතාවයක් තිබුණි. W + W පමණක් භාවිතා කිරීම හා සසඳන විට, OS යෙදුම (W + OS) හරහා JA ව්‍යුත්පන්නවල උච්ච අගයේ විස්තාරණය මූලික වශයෙන් JA වල ප්‍රබල නිශ්චිත දර්ශකයක් බවට පරිවර්තනය කළ හැකිය. අනපේක්ෂිත ලෙස, විවිධ ප්‍රේරක අන්තර්ගතයන් සහිත OSM සහ OSS1 JA සහ JA-Ile සමාන සමුච්චය වීමට හේතු වන බව දන්නා කරුණකි. OSS1 ට ප්‍රතිවිරුද්ධව, OSM විශේෂයෙන් සහ දැඩි ලෙස OSM මගින් ප්‍රේරණය කරනු ලබන අතර, OSS1 මූලික තුවාලවල ප්‍රතිචාරය විස්තාරණය නොකරයි (රූපය 3B).
(A) ශාකභක්ෂක-ප්‍රේරිත ශාක හෝමෝන සමුච්චය චාලක සමාකරණයේ PCC ගණනය කිරීම මත පදනම් වූ සම-ප්‍රකාශන ජාල විශ්ලේෂණය. නෝඩය තනි ශාක හෝමෝනයක් නියෝජනය කරන අතර, නෝඩයේ ප්‍රමාණය ප්‍රතිකාර අතර ශාක හෝමෝනයට විශේෂිත Si දර්ශකය නියෝජනය කරයි. (B) විවිධ වර්ණවලින් දැක්වෙන විවිධ ප්‍රතිකාර මගින් ඇතිවන කොළවල JA, JA-Ile සහ ET සමුච්චය වීම: ඇප්රිකොට් ඇටයේ, W + OSM; නිල්, W + OSSl; කළු, W + W; අළු, C (පාලනය). ප්‍රතිකාර සහ පාලනය අතර සැලකිය යුතු වෙනස්කම් තරු ලකුණු පෙන්නුම් කරයි (ද්වි-මාර්ග ANOVA අනුගමනය කරමින් Tukey HSD පශ්චාත් කාලීන බහු සංසන්දනය, *** P <0.001). JA ජෛව සංස්ලේෂණයේ (C)697 MS/MS (දත්ත ගොනුව S1) සහ ETR1 හි දුර්වල ET සංඥාවක් සහිත දුර්වල සංජානන වර්ණාවලිය (irAOC සහ irCOI1) සහ (D)585 MS/MS (දත්ත ගොනුව S1) හි තොරතුරු න්‍යාය විශ්ලේෂණය අනුකරණය කරන ලද ශාකභක්ෂක ප්‍රතිකාර දෙකක් ශාක රේඛා සහ හිස් වාහන (EV) පාලන ශාක අවුලුවා ඇත. W+OS ප්‍රතිකාරය සහ හානි නොවූ පාලනය අතර සැලකිය යුතු වෙනස්කම් තරු ලකුණු මගින් පෙන්නුම් කෙරේ (ද්වි-මාර්ග ANOVA සහ Tukey HSD පසු කාලීන බහු සංසන්දනය, *P<0.05, **P<0.01 සහ ***P<0.001). (E) විශේෂීකරණයට විසිරුණු විරුද්ධත්වයේ විසිරුණු ප්‍රස්ථාර. වර්ණ විවිධ ජානමය වශයෙන් වෙනස් කරන ලද වික්‍රියා නියෝජනය කරයි; සංකේත විවිධ ප්‍රතිකාර ක්‍රම නියෝජනය කරයි: ත්‍රිකෝණය, W + OSS1; සෘජුකෝණාස්‍රය, W + OSM; කවය C
ඊළඟට, ශාකභක්ෂකයන් මත මෙම ශාක හෝමෝන දෙකෙහි පරිවෘත්තීය විශ්ලේෂණය කිරීම සඳහා JA සහ ET ජෛව සංස්ලේෂණය (irAOC සහ irACO) සහ සංජානනය (irCOI1 සහ sETR1) හි ප්‍රධාන පියවරයන්හිදී අපි ජානමය වශයෙන් වෙනස් කරන ලද දුර්වල වූ නෙපෙන්තස් (irCOI1 සහ sETR1) වික්‍රියාවක් භාවිතා කරමු. නැවත ක්‍රමලේඛනය කිරීමේ සාපේක්ෂ දායකත්වය. පෙර අත්හදා බැලීම්වලට අනුකූලව, හිස් වාහක (EV) ශාකවල ශාකභක්ෂක-OS ප්‍රේරණය (රූපය 3, C සිට D දක්වා) සහ OSM නිසා ඇති වූ Hj දර්ශකයේ සමස්ත අඩුවීම අපි තහවුරු කළ අතර, δj දර්ශකය වැඩි විය. OSS1 මගින් අවුලුවන ලද ප්‍රතිචාරයට වඩා ප්‍රතිචාරය වඩාත් කැපී පෙනේ. Hj සහ δj ඛණ්ඩාංක ලෙස භාවිතා කරන පේළි දෙකක ප්‍රස්ථාරයක් නිශ්චිත නියාමනය ඉවත් කිරීම පෙන්වයි (රූපය 3E). වඩාත්ම පැහැදිලි ප්‍රවණතාවය නම්, JA සංඥාව නොමැති වික්‍රියා වලදී, ශාකභක්ෂකයන් නිසා ඇති වන පරිවෘත්තීය විවිධත්වය සහ විශේෂීකරණ වෙනස්කම් සම්පූර්ණයෙන්ම පාහේ ඉවත් කර ඇති බවයි (රූපය 3C). ඊට වෙනස්ව, sETR1 ශාකවල නිහඬ ET සංජානනය, ශාකභක්ෂක පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලියේ වෙනස්කම් කෙරෙහි සමස්ත බලපෑම JA සංඥාකරණයට වඩා බෙහෙවින් අඩු වුවද, OSM සහ OSS1 උද්දීපනයන් අතර Hj සහ δj දර්ශකවල වෙනස දුර්වල කරයි (රූපය 3D සහ රූපය S5). මෙයින් පෙන්නුම් කරන්නේ JA සංඥා සම්ප්‍රේෂණයේ මූලික කාර්යයට අමතරව, ET සංඥා සම්ප්‍රේෂණය ශාකභක්ෂකයන්ගේ විශේෂ-විශේෂිත පරිවෘත්තීය ප්‍රතිචාරයේ සියුම්-සුසර කිරීමක් ලෙසද ක්‍රියා කරන බවයි. මෙම සියුම්-සුසර කිරීමේ කාර්යයට අනුකූලව, sETR1 ශාකවල සමස්ත පරිවෘත්තීය ප්‍රේරණයේ කිසිදු වෙනසක් සිදු නොවීය. අනෙක් අතට, sETR1 ශාක හා සසඳන විට, irACO ශාක ශාකභක්ෂකයන් නිසා ඇති වන පරිවෘත්තීය වෙනස්කම්වල සමාන සමස්ත විස්තාරයන් ඇති කළ නමුත් OSM සහ OSS1 අභියෝග අතර සැලකිය යුතු ලෙස වෙනස් Hj සහ δj ලකුණු පෙන්නුම් කළේය (රූපය S5).
ශාකභක්ෂකයන්ගේ විශේෂ-නිශ්චිත ප්‍රතිචාරයට වැදගත් දායකත්වයක් ලබා දෙන විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය හඳුනා ගැනීම සහ ET සංඥා හරහා ඒවායේ නිෂ්පාදනය සියුම් ලෙස සකස් කිරීම සඳහා, අපි කලින් සංවර්ධනය කරන ලද ව්‍යුහාත්මක MS/MS ක්‍රමය භාවිතා කළෙමු. මෙම ක්‍රමය MS/MS කොටස් [සාමාන්‍යකරණය කළ තිත් නිෂ්පාදනය (NDP)] සහ උදාසීන අලාභය (NL) මත පදනම් වූ සමානතා ලකුණු වලින් පරිවෘත්තීය පවුල නැවත අනුමාන කිරීම සඳහා ද්වි-පොකුරු කිරීමේ ක්‍රමය මත රඳා පවතී. ET ට්‍රාන්ස්ජෙනික් රේඛා විශ්ලේෂණය හරහා ගොඩනගා ඇති MS/MS දත්ත කට්ටලය 585 MS/MS (දත්ත ගොනුව S1) නිපදවූ අතර, ඒවා ප්‍රධාන MS/MS මොඩියුල හතකට (M) පොකුරු කිරීමෙන් විසඳන ලදී (රූපය 4A). මෙම මොඩියුලවලින් සමහරක් කලින් සංලක්ෂිත විශේෂ පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය වලින් ඝන ලෙස පිරී ඇත: උදාහරණයක් ලෙස, M1, M2, M3, M4 සහ M7 විවිධ ෆීනෝල් ​​ව්‍යුත්පන්න (M1), ෆ්ලේවනොයිඩ් ග්ලයිකෝසයිඩ් (M2), ඇසයිල් සීනි (M3 සහ M4) සහ 17-HGL-DTG (M7) වලින් පොහොසත් වේ. ඊට අමතරව, එක් එක් මොඩියුලයේ තනි පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යයක පරිවෘත්තීය නිශ්චිත තොරතුරු (Si දර්ශකය) ගණනය කරනු ලබන අතර, එහි Si ව්‍යාප්තිය සහජයෙන්ම දැකිය හැකිය. කෙටියෙන් කිවහොත්, ඉහළ ශාකභක්ෂක සහ ප්‍රවේණික නිශ්චිතතාව ප්‍රදර්ශනය කරන MS/MS වර්ණාවලි ඉහළ Si අගයන් මගින් සංලක්ෂිත වන අතර, කර්ටෝසිස් සංඛ්‍යාලේඛන දකුණු වලිග කෙළවරේ ලොම් ව්‍යාප්තිය පෙන්නුම් කරයි. M1 හි එවැනි කෙට්ටු කොලොයිඩ් ව්‍යාප්තියක් අනාවරණය වූ අතර, එහිදී ෆීනෝල් ​​ඇමයිඩ් ඉහළම Si භාගය පෙන්නුම් කළේය (රූපය 4B). M7 හි කලින් සඳහන් කළ ශාකභක්ෂක ප්‍රේරක 17-HGL-DTG මධ්‍යස්ථ Si ලකුණු පෙන්නුම් කළ අතර, OS වර්ග දෙක අතර මධ්‍යස්ථ මට්ටමේ අවකල්‍ය නියාමනයක් පෙන්නුම් කරයි. ඊට වෙනස්ව, රූටින්, CGA සහ ඇසයිල් සීනි වැනි බොහෝ ව්‍යුහාත්මකව නිපදවන ලද විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය, අඩුම Si ලකුණු අතර වේ. විශේෂ පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය අතර ව්‍යුහාත්මක සංකීර්ණතාව සහ Si ව්‍යාප්තිය වඩා හොඳින් ගවේෂණය කිරීම සඳහා, එක් එක් මොඩියුලය සඳහා අණුක ජාලයක් ඉදිකරන ලදී (රූපය 4B). OD න්‍යායේ වැදගත් පුරෝකථනයක් (රූපය 1B හි සාරාංශගත කර ඇත) නම්, ශාකභක්ෂකයන්ට පසුව විශේෂ පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය ප්‍රතිසංවිධානය කිරීම ඉහළ ආරක්ෂක අගයක් සහිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල ඒකපාර්ශ්වික වෙනස්කම් වලට තුඩු දිය යුතු බවයි, විශේෂයෙන් ඒවායේ නිශ්චිතභාවය වැඩි කිරීමෙන් (අහඹු ව්‍යාප්තියට ප්‍රතිවිරුද්ධව) මාදිලිය) MT න්‍යාය මගින් පුරෝකථනය කරන ලද ආරක්ෂක පරිවෘත්තීය. M1 හි එකතු වී ඇති ෆීනෝල් ​​ව්‍යුත්පන්නයන් බොහොමයක් කෘමි ක්‍රියාකාරිත්වයේ පහත වැටීමට ක්‍රියාකාරීව සම්බන්ධ වේ (32). ප්‍රේරිත කොළ සහ EV පාලන ශාකවල සංඝටක කොළ අතර M1 පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල Si අගයන් පැය 24 තුළ සංසන්දනය කිරීමේදී, ශාකභක්ෂක කෘමීන්ගෙන් පසු බොහෝ පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල පරිවෘත්තීය නිශ්චිතතාව සැලකිය යුතු ලෙස වැඩිවන ප්‍රවණතාවක් ඇති බව අපි නිරීක්ෂණය කළෙමු (රූපය 4C). Si අගයෙහි නිශ්චිත වැඩිවීම ආරක්ෂක ෆීනෝලමයිඩ් වල පමණක් අනාවරණය වූ නමුත් මෙම මොඩියුලයේ සහජීවනයෙන් පවතින අනෙකුත් ෆීනෝල් ​​සහ නොදන්නා පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල Si අගයෙහි වැඩි වීමක් අනාවරණය නොවීය. මෙය විශේෂිත ආකෘතියක් වන අතර එය OD න්‍යායට සම්බන්ධ වේ. ශාකභක්ෂකයන් නිසා ඇතිවන පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් පිළිබඳ ප්‍රධාන අනාවැකි අනුකූල වේ. ෆීනොලමයිඩ් වර්ණාවලියේ මෙම විශේෂත්වය OS-විශේෂිත ET මගින් ප්‍රේරණය වී ඇත්දැයි පරීක්ෂා කිරීම සඳහා, අපි පරිවෘත්තීය Si දර්ශකය සැලසුම් කළ අතර EV සහ sETR1 ප්‍රවේණි වර්ගවල OSM සහ OSS1 අතර අවකල ප්‍රකාශන අගයක් ඇති කළෙමු (රූපය 4D). sETR1 හි, OSM සහ OSS1 අතර ෆීනමයිඩ්-ප්‍රේරිත වෙනස බෙහෙවින් අඩු විය. JA-නියාමනය කරන ලද පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණයට අදාළ ප්‍රධාන MS/MS මොඩියුල අනුමාන කිරීමට ප්‍රමාණවත් JA නොමැති වික්‍රියා වල එකතු කරන ලද MS/MS දත්ත සඳහා ද ද්වි-පොකුරු ක්‍රමය යොදන ලදී (රූපය S6).
(A) බෙදාගත් කොටස් (NDP සමානතාවය) සහ බෙදාගත් උදාසීන අලාභය (NL සමානතාවය) මත පදනම් වූ 585 MS/MS වල පොකුරු ප්‍රතිඵලවල ප්‍රතිඵලය වන්නේ මොඩියුලය (M) දන්නා සංයෝග පවුලට අනුකූල වීමයි, නැතහොත් නොදන්නා හෝ දුර්වල ලෙස පරිවෘත්තීය කරන ලද පරිවෘත්තීය සංයුතියෙනි. එක් එක් මොඩියුලයට යාබදව, පරිවෘත්තීය (MS/MS) නිශ්චිත (Si) ව්‍යාප්තිය පෙන්වා ඇත. (B) මොඩියුලර් අණුක ජාලය: නෝඩ් MS/MS සහ දාර නියෝජනය කරයි, NDP (රතු) සහ NL (නිල්) MS/MS ලකුණු (කපා හැරීම,> 0.6). ශ්‍රේණිගත කරන ලද පරිවෘත්තීය නිශ්චිතතා දර්ශකය (Si) මොඩියුලය (වමේ) මත පදනම්ව වර්ණ ගැන්වූ අතර අණුක ජාලයට (දකුණේ) සිතියම්ගත කර ඇත. (C) පැය 24 තුළ ව්‍යුහාත්මක (පාලන) සහ ප්‍රේරිත තත්වයේ (අනුකරණය කරන ලද ශාකභක්ෂක) EV ශාකයේ M1 මොඩියුලය: අණුක ජාල රූප සටහන (Si අගය යනු නෝඩ් ප්‍රමාණයයි, ආරක්ෂක ෆීනෝලමයිඩ් නිල් පැහැයෙන් උද්දීපනය කර ඇත). (D) දුර්වල EV සහ ET සංජානනය සහිත වර්ණාවලි රේඛාවේ sETR1 හි M1 අණුක ජාල රූප සටහන: හරිත කව නෝඩයෙන් නිරූපණය වන ෆීනෝලික් සංයෝගය සහ නෝඩ් ප්‍රමාණය ලෙස W + OSM සහ W + OSS1 ප්‍රතිකාර අතර සැලකිය යුතු වෙනස (P අගය). CP, N-කැෆියොයිල්-ටයිරොසීන්; CS, N-කැෆියොයිල්-ස්පර්මිඩීන්; FP, N-ෆෙරුලික් අම්ලය එස්ටර-යූරික් අම්ලය; FS, N-ෆෙරුලිල්-ස්පර්මිඩීන්; CoP, N', N "-කූමරොලයිල්-ටයිරොසීන්; DCS, N', N"-ඩයිකෆියොයිල්-ස්පර්මිඩීන්; CFS, N', N"-කැෆියොයිල්, ෆෙරුලොයිල්-ස්පර්මිඩීන්; වුල්ෆ්බෙරි සෝන් හි ලයිසියම් බාබරම්; නික්. O-AS, O-acyl සීනි.
අපි විශ්ලේෂණය තවදුරටත් තනි දුර්වල කරන ලද නෙපෙන්තස් ප්‍රවේණික වර්ගයක සිට ස්වාභාවික ජනගහනය දක්වා දීර්ඝ කළෙමු, එහිදී ශාකභක්ෂක JA මට්ටම් සහ නිශ්චිත පරිවෘත්තීය මට්ටම්වල ප්‍රබල අභ්‍යන්තර වෙනස්කම් ස්වාභාවික ජනගහනය තුළ කලින් විස්තර කර ඇත (26). ජර්ම්ප්ලාස්ම් 43ක් ආවරණය කිරීමට මෙම දත්ත කට්ටලය භාවිතා කරන්න. මෙම ජර්ම්ප්ලාස්ම් N. pallens වලින් ශාක විශේෂ 123 කින් සමන්විත වේ. මෙම ශාක උටා, නෙවාඩා, ඇරිසෝනා සහ කැලිෆෝනියාවේ විවිධ ස්වදේශික වාසස්ථානවල එකතු කරන ලද බීජ වලින් ලබා ගන්නා ලදී (රූපය S7), අපි පරිවෘත්තීය විවිධත්වය (මෙහි ජනගහන මට්ටම ලෙස හැඳින්වේ) β විවිධත්වය) සහ OSM මගින් ඇති කරන ලද විශේෂීකරණය ගණනය කළෙමු. පෙර අධ්‍යයනයන්ට අනුකූලව, අපි Hj සහ δj අක්ෂ දිගේ පුළුල් පරාසයක පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් නිරීක්ෂණය කළෙමු, එයින් පෙන්නුම් කරන්නේ ජර්ම්ප්ලාස්ම් ශාකභක්ෂකයන්ට ඔවුන්ගේ පරිවෘත්තීය ප්‍රතිචාරවල ප්ලාස්ටික් බවෙහි සැලකිය යුතු වෙනස්කම් ඇති බවයි (රූපය S7). මෙම සංවිධානය ශාකභක්ෂකයන් නිසා ඇතිවන JA වෙනස්කම්වල ගතික පරාසය පිළිබඳ පෙර නිරීක්ෂණ සිහිපත් කරන අතර තනි ජනගහනයක ඉතා ඉහළ අගයක් පවත්වා ගෙන ඇත (26, 36). Hj සහ δj අතර සමස්ත මට්ටමේ සහසම්බන්ධය පරීක්ෂා කිරීම සඳහා JA සහ JA-Ile භාවිතා කිරීමෙන්, JA සහ පරිවෘත්තීය β විවිධත්වය සහ විශේෂීකරණ දර්ශකය අතර සැලකිය යුතු ධනාත්මක සහසම්බන්ධයක් ඇති බව අපට පෙනී ගියේය (රූපය S7). මෙයින් ඇඟවෙන්නේ ජනගහන මට්ටමින් අනාවරණය වූ JA ප්‍රේරණයේ ශාකභක්ෂක-ප්‍රේරිත විෂමජාතීයතාවය කෘමි ශාකභක්ෂකයන්ගෙන් තෝරා ගැනීම නිසා ඇති වන ප්‍රධාන පරිවෘත්තීය බහුරූපතාවන් නිසා විය හැකි බවයි.
පෙර අධ්‍යයනයන් පෙන්වා දී ඇත්තේ දුම්කොළ වර්ග ප්‍රේරිත සහ ව්‍යුහාත්මක පරිවෘත්තීය ආරක්ෂක මත වර්ගය සහ සාපේක්ෂ යැපීම අනුව බෙහෙවින් වෙනස් බවයි. ශාකභක්ෂක විරෝධී සංඥා සම්ප්‍රේෂණය සහ ආරක්ෂක හැකියාවන්හි මෙම වෙනස්කම් නියාමනය කරනු ලබන්නේ කෘමි ජනගහන පීඩනය, ශාක ජීවන චක්‍රය සහ දී ඇති විශේෂයක් වර්ධනය වන ස්ථානයේ ආරක්ෂක නිෂ්පාදන පිරිවැය මගිනි. උතුරු ඇමරිකාවට සහ දකුණු ඇමරිකාවට ආවේණික නිකොටියානා විශේෂ හයක ශාකභක්ෂකයන් විසින් ප්‍රේරිත කොළ පරිවෘත්තීය ප්‍රතිනිර්මාණයේ අනුකූලතාව අපි අධ්‍යයනය කළෙමු. මෙම විශේෂ උතුරු ඇමරිකාවේ නෙපෙන්තස්, එනම් නිකොලස් බොසිෆ්ලෝ සමඟ සමීපව සම්බන්ධ වේ. ලා, එන්. නිකොටිනිස්, නිකොටියානා එන්. දුර්වල තණකොළ, නිකොටියානා ටැබකම්, රේඛීය දුම්කොළ, දුම්කොළ (නිකොටියානා ස්පෙගසිනි) සහ දුම්කොළ කොළ දුම්කොළ (නිකොටියානා ඔබ්ටුසිෆෝලියා) (රූපය 5A) (37). හොඳින් සංලක්ෂිත විශේෂ N. කරුණාකර ඇතුළුව මෙම විශේෂ හයක් පෙටුනියා ක්ලේඩ් හි වාර්ෂික ශාක වන අතර, obtusifolia N. සහෝදර ක්ලේඩ් ට්‍රයිගොනොෆිලේ හි බහු වාර්ෂික වේ (38). පසුව, කෘමීන් පෝෂණය කිරීමේ විශේෂ මට්ටමේ පරිවෘත්තීය ප්‍රතිසංවිධානය අධ්‍යයනය කිරීම සඳහා මෙම විශේෂ හත මත W + W, W + OSM සහ W + OSS1 ප්‍රේරණය සිදු කරන ලදී.
(A) [න්‍යෂ්ටික ග්ලූටමින් සංස්ලේෂණය සඳහා (38)] උපරිම සම්භාවිතාව සහ සමීපව සම්බන්ධ නිකොටියානා විශේෂ හතක (විවිධ වර්ණ) භූගෝලීය ව්‍යාප්තිය මත පදනම් වූ බූට්ස්ට්‍රැප් ෆයිලොජෙනටික් ගසක් (37). (B) නිකොටියානා විශේෂ හතක පරිවෘත්තීය පැතිකඩ සඳහා විශේෂිත විවිධත්වයේ විසිරුම් කුමන්ත්‍රණයක් (939 MS/MS; දත්ත ගොනුව S1). විශේෂ මට්ටමින්, පරිවෘත්තීය විවිධත්වය විශේෂීකරණයේ මට්ටම සමඟ සෘණාත්මකව සහසම්බන්ධ වේ. පරිවෘත්තීය විවිධත්වය සහ විශේෂීකරණය සහ JA සමුච්චය අතර විශේෂ මට්ටමේ සහසම්බන්ධතාවයේ විශ්ලේෂණය රූපය 2 හි දක්වා ඇත. S9. වර්ණය, විවිධ වර්ග; ත්‍රිකෝණය, W + OSS1; සෘජුකෝණාස්‍රය, W + OSM; (C) නිකොටියානා JA සහ JA-Ile ගතිකය OS උද්දීපන විස්තාරය අනුව ශ්‍රේණිගත කර ඇත (ද්වි-මාර්ග ANOVA සහ Tukey HSD පශ්චාත්-බහු සංසන්දනය, * P <0.05, ** P <0.01 සහ ** W + OS සහ W + W, P <0.001 සංසන්දනය සඳහා). ශාකභක්ෂක සහ මෙතිල් JA (MeJA) අනුකරණය කිරීමෙන් පසු එක් එක් විශේෂයේ (D) විවිධත්වය සහ (E) විශේෂීකරණය පිළිබඳ කොටු බිම් කොටස. තරු ලකුණ W + OS සහ W + W හෝ ලැනොලින් ප්ලස් W (Lan + W) හෝ Lan plus MeJA (Lan + MeJa) සහ Lan පාලනය (විචලතාව පිළිබඳ ද්වි-මාර්ග විශ්ලේෂණය, පසුව ටුකීගේ HSD පශ්චාත් කාලීන බහු සංසන්දනය, *P<0.05, **P<0.01 සහ ***P<0.001) අතර සැලකිය යුතු වෙනස දක්වයි.
ද්විත්ව පොකුරු ක්‍රමය භාවිතා කරමින්, අපි 939 MS/MS (දත්ත ගොනුව S1) මොඩියුල 9ක් හඳුනා ගත්තෙමු. විවිධ ප්‍රතිකාර මගින් නැවත සකස් කරන ලද MS/MS සංයුතිය විශේෂ අතර විවිධ මොඩියුල අතර බෙහෙවින් වෙනස් වේ (රූපය S8). Hj (මෙහි විශේෂ මට්ටමේ γ-විවිධත්වය ලෙස හැඳින්වේ) සහ δj දෘශ්‍යකරණය කිරීමෙන් හෙළි වන්නේ විවිධ විශේෂ පරිවෘත්තීය අවකාශයේ ඉතා වෙනස් කණ්ඩායම් වලට එකතු වන බවයි, එහිදී විශේෂ මට්ටමේ බෙදීම සාමාන්‍යයෙන් උද්දීපනයට වඩා කැපී පෙනේ. N. රේඛීය සහ N. obliquus හැරුණු විට, ඒවා පුළුල් ගතික පරාසයක ප්‍රේරණ බලපෑම් ප්‍රදර්ශනය කරයි (රූපය 5B). ඊට වෙනස්ව, N. purpurea සහ N. obtusifolia වැනි විශේෂවලට ප්‍රතිකාර සඳහා අඩු පැහැදිලි පරිවෘත්තීය ප්‍රතිචාරයක් ඇත, නමුත් පරිවෘත්තීය වඩාත් විවිධාකාර වේ. ප්‍රේරිත පරිවෘත්තීය ප්‍රතිචාරයේ විශේෂ-විශේෂිත ව්‍යාප්තිය විශේෂීකරණය සහ ගැමා විවිධත්වය අතර සැලකිය යුතු සෘණ සහසම්බන්ධයක් ඇති කළේය (PCC = -0.46, P = 4.9×10-8). JA මට්ටම්වල OS-ප්‍රේරිත වෙනස්කම් පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණය සමඟ ධනාත්මකව සහසම්බන්ධ වන අතර, එක් එක් විශේෂය විසින් ප්‍රදර්ශනය කරන ලද පරිවෘත්තීය ගැමා විවිධත්වය සමඟ සෘණාත්මකව සහසම්බන්ධ වේ (රූපය 5B සහ රූපය S9). Nepenthes නෙමටෝඩාවන්, Nepenthes nepenthes, Nepenthes acute සහ Nepenthes attenuated වැනි රූප සටහන 5C හි "සංඥා ප්‍රතිචාර" විශේෂ ලෙස වාචිකව හඳුන්වන විශේෂය මිනිත්තු 30 කින් සැලකිය යුතු සලකුණු ඇති කළ බව සඳහන් කිරීම වටී. මෑත කාලීන OS-විශේෂිත JA සහ JA-Ile පැතිරීම්, Nepenthes mills, Nepenthes powdery සහ N. obtusifolia වැනි "සංඥා ප්‍රතිචාර නොදක්වන" ලෙස හැඳින්වෙන අනෙකුත් බැක්ටීරියා JA-Ile Edge ප්‍රේරණය කිසිදු OS විශේෂත්වයකින් තොරව පමණක් පෙන්වයි (රූපය 5C). ඉහත සඳහන් කළ පරිදි, දුර්වල වූ Nepenthes සඳහා, සංඥා-ප්‍රතිචාර දක්වන ද්‍රව්‍ය OS විශේෂත්වය පෙන්නුම් කළ අතර Hj අඩු කරන අතරතුර δj සැලකිය යුතු ලෙස වැඩි කළේය. සංඥා ප්‍රතික්‍රියාශීලී නොවන විශේෂ ලෙස වර්ගීකරණය කරන ලද විශේෂවල මෙම OS-විශේෂිත ප්‍රාථමික ආචරණය අනාවරණය නොවීය (රූපය 5, D සහ E). OS-විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය සංඥා-ප්‍රතිචාර දක්වන විශේෂ අතර නිතර බෙදා ගන්නා අතර, මෙම සංඥා පොකුරු දුර්වල සංඥා ප්‍රතිචාර සහිත විශේෂ සමඟ පොකුරු වන අතර, දුර්වල සංඥා ප්‍රතිචාර සහිත විශේෂ අඩු අන්තර් රඳා පැවැත්මක් පෙන්නුම් කරයි (රූපය S8). මෙම ප්‍රතිඵලයෙන් පෙන්නුම් කරන්නේ JA වල OS-විශේෂිත ප්‍රේරණය සහ පහළ පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලියේ OS-විශේෂිත නැවත වින්‍යාස කිරීම විශේෂ මට්ටමින් සම්බන්ධ වී ඇති බවයි.
ඊළඟට, ශාකවල සයිටොප්ලාස්මයේ ඇති බාහිර JA මගින් යොදන JA ලබා ගැනීමෙන් මෙම සම්බන්ධක මාතයන් සීමා වී ඇත්දැයි සොයා බැලීම සඳහා අපි මෙතිල් JA (MeJA) අඩංගු ලැනොලින් පේස්ට් එකක් භාවිතා කළෙමු. වේගවත් ඩිස්ටරීකරණය යනු JA ය. JA අඛණ්ඩව සැපයීම නිසා සංඥා-ප්‍රතිචාර දක්වන විශේෂවල සිට සංඥා-ප්‍රතිචාර නොදක්වන විශේෂ දක්වා ක්‍රමයෙන් වෙනස් වීමේ ප්‍රවණතාවය අපට හමු විය (රූපය 5, D සහ E). කෙටියෙන් කිවහොත්, MeJA ප්‍රතිකාරය රේඛීය නෙමටෝඩාවන්, N. obliquus, N. aquaticus, N. pallens සහ N. mikimotoi වල පරිවෘත්තීය දැඩි ලෙස නැවත ක්‍රමලේඛනය කළ අතර, එහි ප්‍රතිඵලයක් ලෙස δj හි සැලකිය යුතු වැඩි වීමක් සහ Hj හි අඩුවීමක් දක්නට ලැබුණි. N. purpurea δj හි වැඩිවීමක් පමණක් පෙන්නුම් කළ නමුත් Hj හි නොවේ. N. obtusifolia, මීට පෙර අතිශයින් අඩු මට්ටම් JAs රැස් කරන බව පෙන්වා දී ඇති අතර, පරිවෘත්තීය නැවත වින්‍යාස කිරීම අනුව MeJA ප්‍රතිකාරයට දුර්වල ලෙස ප්‍රතිචාර දක්වයි. මෙම ප්‍රතිඵලවලින් පෙනී යන්නේ සංඥා-ප්‍රතිචාර නොදක්වන විශේෂවල JA නිෂ්පාදනය හෝ සංඥා සම්ප්‍රේෂණය භෞතික විද්‍යාත්මකව සීමා වී ඇති බවයි. මෙම උපකල්පනය පරීක්ෂා කිරීම සඳහා, අපි W + W, W + OSMs සහ W + OSS1 Transcriptome (39) මගින් ප්‍රේරණය කරන ලද විශේෂ හතර (N. pallens, N. mills, N. pink සහ N. microphylla) අධ්‍යයනය කළෙමු. පරිවෘත්තීය ප්‍රතිනිර්මාණය කිරීමේ රටාවට අනුකූලව, විශේෂය පිටපත් කිරීමේ අවකාශයේ හොඳින් වෙන් වී ඇති අතර, ඒ අතර N. attenuated ඉහළම OS-ප්‍රේරිත RDPI පෙන්නුම් කළ අතර N. gracilis අඩුම අගය පෙන්නුම් කළේය (රූපය 6A). කෙසේ වෙතත්, N. oblonga මගින් ප්‍රේරිත කරන ලද පිටපත් කිරීමේ විවිධත්වය විශේෂ හතර අතර අඩුම අගය බව සොයා ගන්නා ලදී, මීට පෙර විශේෂ හතක පෙන්වා ඇති N. oblonga හි ඉහළම පරිවෘත්තීය විවිධත්වයට පටහැනිව. JA සංඥා ඇතුළුව මුල් ආරක්ෂක සංඥාවලට අදාළ ජාන සමූහයක්, නිකොටියානා විශේෂවල ශාකභක්ෂක-ආශ්‍රිත ප්‍රේරිතයන් විසින් ප්‍රේරිත කරන ලද මුල් ආරක්ෂක ප්‍රතිචාරවල විශේෂත්වය පැහැදිලි කරන බව පෙර අධ්‍යයනයන් පෙන්වා දී ඇත (39). මෙම විශේෂ හතර අතර JA සංඥා මාර්ග සංසන්දනය කිරීමේදී සිත්ගන්නා රටාවක් අනාවරණය විය (රූපය 6B). මෙම මාර්ගයේ ඇති බොහෝ ජාන, උදාහරණයක් ලෙස AOC, OPR3, ACX සහ COI1, මෙම විශේෂ හතර තුළ සාපේක්ෂව ඉහළ මට්ටමේ ප්‍රේරණයක් පෙන්නුම් කළේය. කෙසේ වෙතත්, ප්‍රධාන ජානයක් වන JAR4, JA එහි ජීව විද්‍යාත්මකව ක්‍රියාකාරී JA-Ile සමුච්චිත පිටපත් බවට පරිවර්තනය කරන අතර, එහි පිටපත් කිරීමේ මට්ටම ඉතා අඩුය, විශේෂයෙන් N. mills, Nepenthes pieris සහ N. microphylla වල. ඊට අමතරව, N. bifidum හි තවත් ජානයක් වන AOS හි පිටපත පමණක් අනාවරණය නොවීය. ජාන ප්‍රකාශනයේ මෙම වෙනස්කම් සංඥා නිර්වින්දක විශේෂවල අඩු JA නිෂ්පාදනය සහ N. gracilis ප්‍රේරණය මගින් ඇති කරන ලද ආන්තික ෆීනෝටයිප් සඳහා වගකිව හැකිය.
(A) ශාකභක්ෂක ප්‍රේරණයෙන් මිනිත්තු 30 කට පසු සාම්පල ලබා ගත් සමීපව සම්බන්ධ දුම්කොළ විශේෂ හතරක මුල් පිටපත් කිරීමේ ප්‍රතිචාර නැවත ක්‍රමලේඛනය කිරීමේ තොරතුරු න්‍යාය විශ්ලේෂණය. RDPI ගණනය කරනු ලබන්නේ ශාකභක්ෂක OS මගින් ප්‍රේරණය කරන ලද කොළ තුවාල පාලනය සමඟ සංසන්දනය කිරීමෙනි. වර්ණ විවිධ විශේෂයන් දක්වන අතර සංකේත විවිධ ප්‍රතිකාර ක්‍රම දක්වයි. (B) විශේෂ හතරක් අතර JA සංඥා මාර්ගවල ජාන ප්‍රකාශනය විශ්ලේෂණය කිරීම. සරල කළ JA මාර්ගය කොටු කුමන්ත්‍රණයට යාබදව දක්වා ඇත. විවිධ වර්ණ විවිධ සැකසුම් ක්‍රම දක්වයි. තරු ලකුණ W + OS ප්‍රතිකාරය සහ W + W පාලනය අතර සැලකිය යුතු වෙනසක් ඇති බව පෙන්නුම් කරයි (යුගල වශයෙන් වෙනස්කම් සඳහා ශිෂ්‍යයාගේ t-පරීක්ෂණය සඳහා, *P<0.05, **P<0.01 සහ ***P<0.001). OPDA, 12-oxophytodienoic අම්ලය; OPC-8: 0,3-oxo-2(2′(Z)-pentenyl)-cyclopentane-1-octanoic අම්ලය.
අවසාන කොටසේදී, විවිධ ශාක විශේෂවල පරිවෘත්තීය කෘමි විශේෂ-විශේෂිත ප්‍රතිනිර්මාණය ශාකභක්ෂකයන්ට ප්‍රතිරෝධී විය හැකි ආකාරය අපි අධ්‍යයනය කළෙමු. පෙර පර්යේෂණ මගින් නිකොටියානා කුලය අවධාරණය කරන ලදී. Ms සහ කීටයන්ට ඔවුන්ගේ ප්‍රතිරෝධය බෙහෙවින් වෙනස් වේ (40). මෙහිදී, අපි මෙම ආකෘතිය සහ ඒවායේ පරිවෘත්තීය ප්ලාස්ටික් බව අතර සම්බන්ධතාවය අධ්‍යයනය කළෙමු. ඉහත දුම්කොළ විශේෂ හතර භාවිතා කරමින්, ශාකභක්ෂකයන් නිසා ඇති වන පරිවෘත්තීය විවිධත්වය සහ විශේෂීකරණය සහ Ms සහ Sl වලට ශාකවල ප්‍රතිරෝධය අතර සහසම්බන්ධය පරීක්ෂා කිරීමෙන්, සාමාන්‍ය Sl සඳහා ප්‍රතිරෝධය, විවිධත්වය සහ විශේෂීකරණය ධනාත්මක සහසම්බන්ධතාවයක් ඇති බව අපට පෙනී ගිය අතර, විශේෂඥ කාන්තාවන්ට ප්‍රතිරෝධය සහ විශේෂීකරණය අතර සහසම්බන්ධය දුර්වල වන අතර, විවිධත්වය සමඟ සහසම්බන්ධය සැලකිය යුතු නොවේ (රූපය S10). S1 ප්‍රතිරෝධය සම්බන්ධයෙන්, JA සංඥා සම්ප්‍රේෂණ මට්ටම් සහ පරිවෘත්තීය ප්ලාස්ටික් බව යන දෙකම ප්‍රදර්ශනය කරන බව කලින් පෙන්වා දුන් දුර්වල වූ N. chinensis සහ N. gracilis යන දෙකම ශාකභක්ෂක ප්‍රේරණයට බෙහෙවින් වෙනස් ප්‍රතිචාර දැක්වූ අතර, ඔවුන් සමාන ඉහළ ප්‍රතිරෝධයක් ද පෙන්නුම් කළහ. ලිංගිකත්වය.
පසුගිය වසර හැට තුළ, ශාක ආරක්ෂක න්‍යාය න්‍යායාත්මක රාමුවක් සපයා ඇති අතර, ඒ මත පදනම්ව පර්යේෂකයන් ශාක විශේෂිත පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල පරිණාමය සහ ක්‍රියාකාරිත්වය සැලකිය යුතු සංඛ්‍යාවක් පුරෝකථනය කර ඇත. මෙම න්‍යායන් බොහොමයක් ශක්තිමත් නිගමනවල සාමාන්‍ය ක්‍රියා පටිපාටිය අනුගමනය නොකරයි (41). ඔවුන් එකම මට්ටමේ විශ්ලේෂණ වලදී ප්‍රධාන අනාවැකි (3) යෝජනා කරයි. ප්‍රධාන අනාවැකි පරීක්ෂා කිරීමෙන් නිශ්චිත න්‍යායන් විශ්ලේෂණය කිරීමට ඉඩ සලසන විට, මෙය ක්ෂේත්‍රය ඉදිරියට යන බවට පත් කරනු ඇත. සහාය දක්වන්න, නමුත් අනෙක් ඒවා ප්‍රතික්ෂේප කරන්න (42). ඒ වෙනුවට, නව න්‍යාය විවිධ විශ්ලේෂණ මට්ටම්වල අනාවැකි ඉදිරිපත් කරන අතර විස්තරාත්මක සලකා බැලීම්වල නව ස්ථරයක් එක් කරයි (42). කෙසේ වෙතත්, ක්‍රියාකාරී මට්ටමේ යෝජනා කර ඇති න්‍යායන් දෙක, MT සහ OD, ශාකභක්ෂකයන් නිසා ඇතිවන විශේෂිත පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් පිළිබඳ වැදගත් අනාවැකි ලෙස පහසුවෙන් පැහැදිලි කළ හැකිය: OD න්‍යාය විශ්වාස කරන්නේ විශේෂිත පරිවෘත්තීය "අවකාශයේ" වෙනස්කම් ඉතා දිශානුගත බවයි. MT න්‍යාය විශ්වාස කරන්නේ මෙම වෙනස්කම් දිශානුගත නොවන අතර අහඹු ලෙස පරිවෘත්තීය අවකාශයේ පිහිටා ඇති අතර ඉහළ ආරක්ෂක වටිනාකමක් ඇති පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය ඇති බවයි. OD සහ MT අනාවැකි පිළිබඳ පෙර පරීක්ෂණ පූර්ව "ආරක්ෂක" සංයෝගවල පටු කට්ටලයක් භාවිතයෙන් පරීක්ෂා කර ඇත. මෙම පරිවෘත්තීය කේන්ද්‍රීය පරීක්ෂණ මගින් ශාකභක්ෂක කාලය තුළ පරිවෘත්තීය ප්‍රතිසංවිධානයේ ප්‍රමාණය සහ ගමන් පථය විශ්ලේෂණය කිරීමේ හැකියාව වළක්වන අතර, සමස්තයක් ලෙස සැලකිය හැකි ප්‍රධාන අනාවැකි අවශ්‍ය කිරීමට ස්ථාවර සංඛ්‍යානමය රාමුවක් තුළ පරීක්ෂා කිරීමට ඉඩ නොදේ. ශාක පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් ප්‍රමාණනය කරන්න. මෙහිදී, අපි පරිගණකමය MS මත පදනම් වූ පරිවෘත්තීය විද්‍යාවේ නව්‍ය තාක්‍ෂණය භාවිතා කළ අතර ගෝලීය පරිවෘත්තීය මට්ටමින් යෝජනා කර ඇති දෙක අතර වෙනස පරීක්ෂා කිරීම සඳහා තොරතුරු න්‍යාය විස්තර කරන්නන්ගේ සාමාන්‍ය මුදල් ඒකකයේ විසංයෝජන MS විශ්ලේෂණය සිදු කළෙමු. මෙම න්‍යායේ ප්‍රධාන පුරෝකථනය. තොරතුරු න්‍යාය බොහෝ ක්ෂේත්‍රවල, විශේෂයෙන් ජෛව විවිධත්වය සහ පෝෂක ප්‍රවාහ පර්යේෂණ සන්දර්භය තුළ යොදාගෙන ඇත (43). කෙසේ වෙතත්, අප දන්නා පරිදි, මෙය ශාකවල පරිවෘත්තීය තොරතුරු අවකාශය විස්තර කිරීමට සහ පාරිසරික ඉඟි වලට ප්‍රතිචාර වශයෙන් තාවකාලික පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් වලට අදාළ පාරිසරික ගැටළු විසඳීමට භාවිතා කරන පළමු යෙදුමයි. විශේෂයෙන්, මෙම ක්‍රමයේ හැකියාව පවතින්නේ ශාක විශේෂ තුළ සහ ශාක විශේෂ අතර රටා සංසන්දනය කිරීමේ හැකියාව තුළ වන අතර ශාකභක්ෂකයන් විවිධ විශේෂවල සිට අන්තර්-විශේෂ සාර්ව පරිණාමීය රටා දක්වා විවිධ පරිණාමයේ මට්ටම්වල පරිණාමය වී ඇති ආකාරය පරීක්ෂා කිරීමට හැකියාව ඇත. පරිවෘත්තීය.
ප්‍රධාන සංරචක විශ්ලේෂණය (PCA) බහුවිචල්‍ය දත්ත කට්ටලයක් මාන අඩු කිරීමේ අවකාශයක් බවට පරිවර්තනය කරයි, එවිට දත්තවල ප්‍රධාන ප්‍රවණතාවය පැහැදිලි කළ හැකිය, එබැවින් එය සාමාන්‍යයෙන් දත්ත කට්ටලය විග්‍රහ කිරීම සඳහා ගවේෂණාත්මක තාක්‍ෂණයක් ලෙස භාවිතා කරයි, උදාහරණයක් ලෙස විසංයෝජන පරිවෘත්තීය. කෙසේ වෙතත්, මාන අඩු කිරීම දත්ත කට්ටලයේ තොරතුරු අන්තර්ගතයෙන් කොටසක් අහිමි වන අතර, PCA හට පාරිසරික න්‍යායට විශේෂයෙන් අදාළ වන ලක්ෂණ පිළිබඳ ප්‍රමාණාත්මක තොරතුරු සැපයිය නොහැක, එනම්: ශාකභක්ෂකයන් විශේෂිත ක්ෂේත්‍රවල විවිධත්වය නැවත වින්‍යාස කරන ආකාරය (උදාහරණයක් ලෙස, පොහොසත්කම, ව්‍යාප්තිය) සහ බහුලත්වය) පරිවෘත්තීය? දී ඇති ශාකභක්ෂකයෙකුගේ ප්‍රේරිත තත්වයේ පුරෝකථනය කරන්නන් වන්නේ කුමන පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යද? නිශ්චිතතාව, විවිධත්වය සහ ප්‍රේරකතාවයේ දෘෂ්ටිකෝණයෙන්, පත්‍ර-නිශ්චිත පරිවෘත්තීය පැතිකඩෙහි තොරතුරු අන්තර්ගතය දිරාපත් වී ඇති අතර, ශාකභක්ෂකයන් ආහාරයට ගැනීමෙන් නිශ්චිත පරිවෘත්තීය සක්‍රීය කළ හැකි බව සොයාගෙන ඇත. අනපේක්ෂිත ලෙස, ක්‍රියාත්මක කරන ලද තොරතුරු න්‍යාය දර්ශකවල විස්තර කර ඇති පරිදි, ශාකභක්ෂකයන් දෙදෙනාගේ (රාත්‍රී-පෝෂිත සාමාන්‍ය විද්‍යාඥ Sl) සහ සොලනේසි විශේෂඥ මහත්මියගේ ප්‍රහාරවලින් පසු ප්‍රතිඵලයක් ලෙස පරිවෘත්තීය තත්ත්වය විශාල අතිච්ඡාදනයක් ඇති බව අපි නිරීක්ෂණය කළෙමු. ඔවුන්ගේ පෝෂණ හැසිරීම සහ සාන්ද්‍රණය සැලකිය යුතු ලෙස වෙනස් වුවද. OS (31) හි මේද අම්ල-ඇමයිනෝ අම්ල සංයුක්ත (FAC) ආරම්භකය. ප්‍රමිතිගත සිදුරු තුවාල වලට ප්‍රතිකාර කිරීම සඳහා ශාකභක්ෂක OS භාවිතා කිරීමෙන්, අනුකරණය කරන ලද ශාකභක්ෂක ප්‍රතිකාරය ද සමාන ප්‍රවණතාවක් පෙන්නුම් කළේය. ශාකභක්ෂක ප්‍රහාරවලට ශාකවල ප්‍රතිචාරය අනුකරණය කිරීම සඳහා වූ මෙම ප්‍රමිතිගත ක්‍රියා පටිපාටිය, විවිධ කාලවලදී විවිධ මට්ටමේ හානිවලට තුඩු දෙන ශාකභක්ෂකයන්ගේ ආහාර ගැනීමේ හැසිරීම් වල වෙනස්කම් නිසා ඇතිවන ව්‍යාකූල සාධක ඉවත් කරයි (34). OSM හි ප්‍රධාන හේතුව ලෙස දන්නා FAC, OSS1 හි JAS සහ අනෙකුත් ශාක හෝමෝන ප්‍රතිචාර අඩු කරන අතර OSS1 සිය ගුණයකින් අඩු කරයි (31). කෙසේ වෙතත්, OSM හා සසඳන විට OSS1 සමාන JA සමුච්චය මට්ටම් ඇති කළේය. දුර්වල වූ නෙපෙන්තස් හි JA ප්‍රතිචාරය OSM වලට ඉතා සංවේදී බව මීට පෙර පෙන්වා දී ඇති අතර, එහිදී FAC ජලය සමඟ 1:1000 තනුක කළත් එහි ක්‍රියාකාරිත්වය පවත්වා ගත හැකිය (44). එබැවින්, OSM හා සසඳන විට, OSS1 හි FAC ඉතා අඩු වුවද, ප්‍රමාණවත් JA පැතිරීමක් ඇති කිරීමට එය ප්‍රමාණවත් වේ. පෙර අධ්‍යයනයන් පෙන්වා දී ඇත්තේ පෝරින් වැනි ප්‍රෝටීන (45) සහ ඔලිගෝසැකරයිඩ (46) OSS1 හි ශාක ආරක්ෂක ප්‍රතිචාර අවුලුවාලීම සඳහා අණුක ඉඟි ලෙස භාවිතා කළ හැකි බවයි. කෙසේ වෙතත්, වත්මන් අධ්‍යයනයේ නිරීක්ෂණය කරන ලද JA සමුච්චය වීමට OSS1 හි මෙම උත්තේජක වගකිව යුතුද යන්න තවමත් පැහැදිලි නැත.
විවිධ ශාකභක්ෂකයන් හෝ බාහිර JA හෝ SA (සැලිසිලික් අම්ලය) යෙදීමෙන් ඇතිවන අවකල පරිවෘත්තීය ඇඟිලි සලකුණු විස්තර කරන අධ්‍යයන කිහිපයක් තිබුණද (47), ශාක තෘණ ජාලයේ ශාකභක්ෂක විශේෂ-විශේෂිත කැළඹීම සහ එහි නිශ්චිත බලපෑම් කිසිවෙකු කැළඹීමට ලක් කර නොමැත. පරිවෘත්තීයතාවයේ සමස්ත බලපෑම ක්‍රමානුකූලව අධ්‍යයනය කෙරේ. පුද්ගලික තොරතුරු. JAs හැර අනෙකුත් ශාක හෝමෝන සමඟ අභ්‍යන්තර හෝමෝන ජාල සම්බන්ධතාවය ශාකභක්ෂකයන් විසින් ඇති කරන ලද පරිවෘත්තීය ප්‍රතිසංවිධානයේ විශේෂත්වය හැඩගස්වන බව මෙම විශ්ලේෂණය තවදුරටත් තහවුරු කළේය. විශේෂයෙන්, OSM මගින් ඇති කරන ලද ET OSS1 මගින් ඇති කරන ලද ප්‍රමාණයට වඩා සැලකිය යුතු ලෙස වැඩි බව අපි අනාවරණය කළෙමු. මෙම මාදිලිය OSM හි වැඩි FAC අන්තර්ගතයකට අනුකූල වන අතර එය ET පිපිරීමක් අවුලුවාලීම සඳහා අවශ්‍ය සහ ප්‍රමාණවත් කොන්දේසියකි (48). ශාක සහ ශාකභක්ෂකයන් අතර අන්තර්ක්‍රියාවේ සන්දර්භය තුළ, ශාක-විශේෂිත පරිවෘත්තීය ගතිකය මත ET හි සංඥා කාර්යය තවමත් වරින් වර පවතින අතර තනි සංයෝග කණ්ඩායමක් පමණක් ඉලක්ක කරයි. මීට අමතරව, බොහෝ අධ්‍යයනයන් ET නියාමනය අධ්‍යයනය කිරීම සඳහා ET හෝ එහි පූර්වගාමීන් හෝ විවිධ නිෂේධකවල බාහිර යෙදීම භාවිතා කර ඇති අතර, ඒ අතර මෙම බාහිර රසායනික යෙදුම් බොහෝ නිශ්චිත නොවන අතුරු ආබාධ ඇති කරයි. අපගේ දැනුමට අනුව, මෙම අධ්‍යයනය ශාක පරිවෘත්තීය ගතිකත්වය සම්බන්ධීකරණය කිරීම සඳහා දුර්වල වූ සංක්‍රාන්ති ශාක නිපදවීමට සහ සංජානනය කිරීමට ET භාවිතයේදී ET හි කාර්යභාරය පිළිබඳ පළමු මහා පරිමාණ ක්‍රමානුකූල පරීක්ෂණය නියෝජනය කරයි. ශාකභක්ෂක-විශේෂිත ET ප්‍රේරණය අවසානයේ පරිවෘත්තීය ප්‍රතිචාරය මොඩියුලේට් කළ හැකිය. වඩාත්ම වැදගත් වන්නේ ශාකභක්ෂක-විශේෂිත ඩි නවෝ ෆීනොලමයිඩ් සමුච්චය හෙළි කළ ET ජෛව සංස්ලේෂණය (ACO) සහ සංජානනය (ETR1) ජානවල සංක්‍රාන්ති හැසිරවීමයි. පුට්‍රෙස්සීන් N-මෙතිල්ට්‍රාන්ස්ෆෙරේස් නියාමනය කිරීමෙන් ET හට JA-ප්‍රේරිත නිකොටින් සමුච්චය සියුම් ලෙස සකස් කළ හැකි බව මීට පෙර පෙන්වා දී ඇත (49). කෙසේ වෙතත්, යාන්ත්‍රික දෘෂ්ටි කෝණයකින්, ET ෆීනමයිඩ් ප්‍රේරණය සියුම් ලෙස සකස් කරන්නේ කෙසේද යන්න පැහැදිලි නැත. ET හි සංඥා සම්ප්‍රේෂණ ශ්‍රිතයට අමතරව, පොලිඇමිනොෆීනෝල් ​​ඇමයිඩවල ආයෝජනය නියාමනය කිරීම සඳහා පරිවෘත්තීය ප්‍රවාහය S-ඇඩිනොසිල්-1-මෙතියොනීන් වෙත මාරු කළ හැකිය. S-ඇඩිනොසිල්-1-මෙතියොනීන් යනු පොලිඇමයින් ජෛව සංස්ලේෂණ මාර්ගයේ ET සහ පොදු අතරමැදි වේ. ET සංඥාව ෆීනෝලමයිඩ් මට්ටම නියාමනය කරන යාන්ත්‍රණය තවදුරටත් අධ්‍යයනය කිරීම අවශ්‍ය වේ.
දිගු කලක් තිස්සේ, නොදන්නා ව්‍යුහයේ විශේෂ පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය විශාල සංඛ්‍යාවක් නිසා, නිශ්චිත පරිවෘත්තීය කාණ්ඩ කෙරෙහි දැඩි අවධානයක් යොමු කිරීමෙන් ජීව විද්‍යාත්මක අන්තර්ක්‍රියා වලින් පසු පරිවෘත්තීය විවිධත්වයේ තාවකාලික වෙනස්කම් දැඩි ලෙස තක්සේරු කිරීමට නොහැකි වී තිබේ. වර්තමානයේ, තොරතුරු න්‍යාය විශ්ලේෂණය මත පදනම්ව, අපක්ෂපාතී පරිවෘත්තීය මත පදනම් වූ MS/MS වර්ණාවලි අත්පත් කර ගැනීමේ ප්‍රධාන ප්‍රතිඵලය වන්නේ, ශාකභක්ෂකයන් ආහාරයට ගැනීම හෝ අනුකරණය කිරීම මගින් ශාකභක්ෂකයන් පත්‍ර පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යයේ සමස්ත පරිවෘත්තීය විවිධත්වය අඩු කරන අතරම එහි විශේෂීකරණයේ මට්ටම වැඩි කිරීමයි. ශාකභක්ෂකයන් නිසා ඇතිවන පරිවෘත්තීය නිශ්චිතතාවයේ මෙම තාවකාලික වැඩිවීම පිටපත් කිරීමේ නිශ්චිතතාවයේ සහජීවන වැඩි වීමක් සමඟ සම්බන්ධ වේ. මෙම විශාල පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණයට (ඉහළ Si අගයක් ඇති) වඩාත්ම දායක වන ලක්ෂණය වන්නේ කලින් සංලක්ෂිත ශාකභක්ෂක ශ්‍රිතය සහිත විශේෂ පරිවෘත්තීය වේ. මෙම ආකෘතිය OD න්‍යායේ පුරෝකථනයට අනුකූල වේ, නමුත් පරිවෘත්තීය නැවත ක්‍රමලේඛනය කිරීමේ අහඹු බව හා සම්බන්ධ MT හි පුරෝකථනය අනුකූල නොවේ. කෙසේ වෙතත්, මෙම දත්ත මිශ්‍ර ආකෘතියේ පුරෝකථනයට ද අනුකූල වේ (හොඳම MT; රූපය 1B), මන්ද නොදන්නා ආරක්ෂක කාර්යයන් සහිත අනෙකුත් සංලක්ෂිත නොකළ පරිවෘත්තීය තවමත් අහඹු Si ව්‍යාප්තියක් අනුගමනය කළ හැකිය.
මෙම පර්යේෂණය මගින් තවදුරටත් ග්‍රහණය කරගත් කැපී පෙනෙන රටාවක් නම්, ක්ෂුද්‍ර පරිණාම මට්ටමේ (තනි ශාක හා දුම්කොළ ජනගහනය) සිට විශාල පරිණාමීය පරිමාණයක් (සමීපව සම්බන්ධ දුම්කොළ විශේෂ) දක්වා, පරිණාමීය සංවිධානයේ විවිධ මට්ටම් "හොඳම ආරක්ෂාව" තුළ පවතින බවයි. ශාකභක්ෂකයන්ගේ හැකියාවන්හි සැලකිය යුතු වෙනස්කම් තිබේ. මුවර් සහ වෙනත් අය. (20) සහ කෙස්ලර් සහ කල්ස්කේ (1) ස්වාධීනව විටේකර් (50) විසින් මුලින් වෙන්කර හඳුනා ගන්නා ලද ජෛව විවිධත්වයේ ක්‍රියාකාරී මට්ටම් තුන රසායනික විවිධත්වයේ ව්‍යුහාත්මක සහ ප්‍රේරිත තාවකාලික වෙනස්කම් බවට පරිවර්තනය කිරීමට යෝජනා කළහ; මෙම කතුවරුන් සාරාංශ කර නැත. මහා පරිමාණ පරිවෘත්තීය දත්ත එකතු කිරීම සඳහා වූ ක්‍රියා පටිපාටි මෙම දත්ත වලින් පරිවෘත්තීය විවිධත්වය ගණනය කරන්නේ කෙසේද යන්න ද දක්වා නැත. මෙම අධ්‍යයනයේදී, විටේකර්ගේ ක්‍රියාකාරී වර්ගීකරණයට සුළු ගැලපීම් මඟින් α-පරිවෘත්තීය විවිධත්වය දී ඇති ශාකයක MS/MS වර්ණාවලිවල විවිධත්වය ලෙසත්, β-පරිවෘත්තීය විවිධත්වය ජනගහන සමූහයක මූලික අභ්‍යන්තර පරිවෘත්තීය ලෙසත් සලකනු ඇත. අවකාශය, සහ γ-පරිවෘත්තීය විවිධත්වය සමාන විශේෂ විශ්ලේෂණයේ දිගුවක් වනු ඇත.
පුළුල් පරාසයක ශාකභක්ෂක පරිවෘත්තීය ප්‍රතිචාර සඳහා JA සංඥාව අත්‍යවශ්‍ය වේ. කෙසේ වෙතත්, පරිවෘත්තීය විවිධත්වයට JA ජෛව සංස්ලේෂණයේ අභ්‍යන්තර විශේෂිත නියාමනයේ දායකත්වය පිළිබඳ දැඩි ප්‍රමාණාත්මක පරීක්ෂණ නොමැතිකම පවතින අතර, JA සංඥාව ඉහළ සාර්ව පරිමාණ පරිමාණයකින් ආතතියෙන් ඇතිවන පරිවෘත්තීය විවිධාංගීකරණය සඳහා සාමාන්‍ය ස්ථානයක්ද යන්න තවමත් අපැහැදිලි ය. නෙපෙන්තස් ශාකභක්ෂකයන්ගේ ශාකභක්ෂක ස්වභාවය පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණය ඇති කරන බවත්, නිකොටියානා විශේෂවල ජනගහනය තුළ සහ සමීපව සම්බන්ධ වූ නිකොටියානා විශේෂ අතර පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණයේ විචලනය ක්‍රමානුකූලව ධනාත්මකව JA සංඥාකරණය සමඟ සහසම්බන්ධ වන බවත් අපි නිරීක්ෂණය කළෙමු. ඊට අමතරව, JA සංඥාව දුර්වල වූ විට, තනි ප්‍රවේණික ශාකභක්ෂකයෙකු විසින් ඇති කරන ලද පරිවෘත්තීය නිශ්චිතතාව අවලංගු වේ (රූපය 3, C සහ E). ස්වභාවිකව දුර්වල වූ නෙපෙන්තස් ජනගහනයේ පරිවෘත්තීය වර්ණාවලී වෙනස්කම් බොහෝ දුරට ප්‍රමාණාත්මක බැවින්, මෙම විශ්ලේෂණයේ පරිවෘත්තීය β විවිධත්වයේ සහ විශේෂත්වයේ වෙනස්කම් බොහෝ දුරට පරිවෘත්තීය-පොහොසත් සංයෝග කාණ්ඩවල ප්‍රබල උද්දීපනය නිසා ඇති විය හැක. මෙම සංයෝග පන්ති පරිවෘත්තීය පැතිකඩෙහි කොටසක් ආධිපත්‍යය දරන අතර JA සංඥා සමඟ ධනාත්මක සහසම්බන්ධයකට මග පාදයි.
දුම්කොළ විශේෂවලට සමීපව සම්බන්ධ ජෛව රසායනික යාන්ත්‍රණ බෙහෙවින් වෙනස් බැවින්, පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය ගුණාත්මක අංශයෙන් විශේෂයෙන් හඳුනාගෙන ඇති බැවින් එය වඩාත් විශ්ලේෂණාත්මක වේ. ග්‍රහණය කරගත් පරිවෘත්තීය පැතිකඩ පිළිබඳ තොරතුරු න්‍යායේ සැකසීමෙන් හෙළි වන්නේ ශාකභක්ෂක ප්‍රේරණය පරිවෘත්තීය ගැමා විවිධත්වය සහ විශේෂීකරණය අතර හුවමාරුව උග්‍ර කරන බවයි. මෙම හුවමාරුවේදී JA සංඥාව ප්‍රධාන කාර්යභාරයක් ඉටු කරයි. පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණයේ වැඩිවීම ප්‍රධාන OD අනාවැකියට අනුකූල වන අතර JA සංඥාව සමඟ ධනාත්මකව සහසම්බන්ධ වන අතර JA සංඥාව පරිවෘත්තීය ගැමා විවිධත්වය සමඟ සෘණාත්මකව සහසම්බන්ධ වේ. මෙම ආකෘතිවලින් පෙන්නුම් කරන්නේ ශාකවල OD ධාරිතාව ප්‍රධාන වශයෙන් තීරණය වන්නේ ක්ෂුද්‍ර පරිමාණයෙන් හෝ විශාල පරිණාමීය පරිමාණයකින් වේවා JA හි ප්ලාස්ටික් බව මගිනි. JA ජෛව සංස්ලේෂණ දෝෂ මඟ හරින බාහිර JA යෙදුම් අත්හදා බැලීම් තවදුරටත් හෙළි කරන්නේ සමීපව සම්බන්ධ දුම්කොළ විශේෂ සංඥා-ප්‍රතිචාරාත්මක සහ සංඥා-ප්‍රතිචාර නොදක්වන විශේෂ ලෙස වෙන්කර හඳුනාගත හැකි බවයි, ඒවායේ JA මාදිලිය සහ ශාකභක්ෂකයන් විසින් ප්‍රේරණය කරන ලද පරිවෘත්තීය ප්ලාස්ටික් බව මෙන්. සංඥා ප්‍රතිචාර නොදක්වන විශේෂවලට ආවේණික JA නිපදවීමට ඇති නොහැකියාව නිසා ප්‍රතිචාර දැක්විය නොහැකි අතර එම නිසා භෞතික විද්‍යාත්මක සීමාවන්ට යටත් වේ. මෙය JA සංඥා මාර්ගයේ (N. crescens හි AOS සහ JAR4) සමහර ප්‍රධාන ජානවල විකෘති නිසා ඇති විය හැක. මෙම ප්‍රතිඵලය ඉස්මතු කරන්නේ මෙම අන්තර් විශේෂ සාර්ව පරිණාමීය රටා ප්‍රධාන වශයෙන් අභ්‍යන්තර හෝමෝන සංජානනයේ සහ ප්‍රතිචාර දැක්වීමේ වෙනස්වීම් මගින් මෙහෙයවනු ලැබිය හැකි බවයි.
ශාක හා ශාකභක්ෂකයන් අතර අන්තර්ක්‍රියාවට අමතරව, පරිවෘත්තීය විවිධත්වය ගවේෂණය කිරීම පරිසරයට ජීව විද්‍යාත්මක අනුවර්තනය සහ සංකීර්ණ ෆීනෝටයිපික් ලක්ෂණ පරිණාමය පිළිබඳ පර්යේෂණයේ සියලු වැදගත් න්‍යායික දියුණුවට සම්බන්ධ වේ. නවීන MS උපකරණ මගින් ලබාගත් දත්ත ප්‍රමාණය වැඩිවීමත් සමඟ, පරිවෘත්තීය විවිධත්වය පිළිබඳ උපකල්පිත පරීක්ෂණයට දැන් තනි/කාණ්ඩ පරිවෘත්තීය වෙනස්කම් ඉක්මවා ගොස් අනපේක්ෂිත රටා හෙළි කිරීමට ගෝලීය විශ්ලේෂණයක් සිදු කළ හැකිය. මහා පරිමාණ විශ්ලේෂණ ක්‍රියාවලියේදී, වැදගත් රූපකයක් වන්නේ දත්ත ගවේෂණය කිරීමට භාවිතා කළ හැකි අර්ථවත් සිතියම් සංකල්පනය කිරීමේ අදහසයි. එබැවින්, අපක්ෂපාතී MS/MS පරිවෘත්තීය හා තොරතුරු න්‍යායේ වර්තමාන සංයෝජනයේ වැදගත් ප්‍රතිඵලයක් නම්, එය විවිධ වර්ගීකරණ පරිමාණයන් මත පරිවෘත්තීය විවිධත්වය පිරික්සීමට සිතියම් තැනීමට භාවිතා කළ හැකි සරල මිතිකයක් සපයයි. එය මෙම ක්‍රමයේ මූලික අවශ්‍යතාවයයි. ක්ෂුද්‍ර/සාර්ව පරිණාමය සහ ප්‍රජා පරිසර විද්‍යාව පිළිබඳ අධ්‍යයනය.
සාර්ව-පරිණාමීය මට්ටමින්, එර්ලිච් සහ රේවන්ගේ (51) ශාක-කෘමි සම-පරිණාම න්‍යායේ හරය වන්නේ අන්තර් විශේෂ පරිවෘත්තීය විවිධත්වයේ විචලනය ශාක පරම්පරාවල විවිධාංගීකරණයට හේතුව බව පුරෝකථනය කිරීමයි. කෙසේ වෙතත්, මෙම ශුක්‍රාණු කෘතිය ප්‍රකාශයට පත් කිරීමෙන් පසු වසර පනහ තුළ, මෙම උපකල්පනය කලාතුරකින් පරීක්ෂා කර ඇත (52). මෙය බොහෝ දුරට දිගු දුර ශාක පරම්පරාවල සැසඳිය හැකි පරිවෘත්තීය ලක්ෂණවල ෆයිලොජෙනටික් ලක්ෂණ නිසාය. ඉලක්ක විශ්ලේෂණ ක්‍රම නැංගුරම් ලෑමට දුර්ලභත්වය භාවිතා කළ හැකිය. තොරතුරු න්‍යාය මගින් සකසන ලද වත්මන් MS/MS වැඩ ප්‍රවාහය නොදන්නා පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල MS/MS ව්‍යුහාත්මක සමානතාවය (පූර්ව පරිවෘත්තීය තේරීමකින් තොරව) ප්‍රමාණනය කරන අතර මෙම MS/MS කට්ටලයක් බවට පරිවර්තනය කරයි, එබැවින් වෘත්තීය පරිවෘත්තීය ක්‍රියාවලියේදී මෙම සාර්ව-පරිණාමීය ආකෘති වර්ගීකරණ පරිමාණයෙන් සංසන්දනය කෙරේ. සරල සංඛ්‍යානමය දර්ශක. මෙම ක්‍රියාවලිය ෆයිලොජෙනටික් විශ්ලේෂණයට සමාන වන අතර, පූර්ව පුරෝකථනයකින් තොරව විවිධාංගීකරණයේ හෝ චරිත පරිණාමයේ අනුපාතය ප්‍රමාණනය කිරීම සඳහා අනුක්‍රමික පෙළගැස්ම භාවිතා කළ හැකිය.
ජෛව රසායනික මට්ටමින්, ෆර්න් සහ ජෝන්ස් (53) ගේ පරීක්ෂණ කල්පිතය පෙන්නුම් කරන්නේ, කලින් සම්බන්ධ නොවූ හෝ ආදේශ කරන ලද පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාකාරකම් ක්‍රියාත්මක කිරීම සඳහා අමුද්‍රව්‍ය සැපයීම සඳහා පරිවෘත්තීය විවිධත්වය විවිධ මට්ටම්වල පවත්වා ගෙන යන බවයි. තොරතුරු න්‍යාය ක්‍රම මගින් යෝජිත පරිණාමීය පරීක්ෂණ ක්‍රියාවලියේ කොටසක් ලෙස පරිවෘත්තීය විශේෂීකරණය අතරතුර සිදුවන මෙම පරිවෘත්තීය-විශේෂිත පරිණාමීය සංක්‍රාන්ති ප්‍රමාණනය කළ හැකි රාමුවක් සපයයි: අඩු නිශ්චිතතාවයේ සිට ඉහළ නිශ්චිතතාවයට ජීව විද්‍යාත්මකව ක්‍රියාකාරී අනුවර්තනය දී ඇති පරිසරයක නිෂේධනය කරන ලද පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය.
සමස්තයක් වශයෙන් ගත් කල, අණුක ජීව විද්‍යාවේ මුල් අවධියේදී, වැදගත් ශාක ආරක්ෂක න්‍යායන් සංවර්ධනය කරන ලද අතර, අඩු කිරීමේ උපකල්පිත-ධාවන ක්‍රම විද්‍යාත්මක ප්‍රගතියේ එකම මාධ්‍යය ලෙස පුළුල් ලෙස සැලකේ. මෙය බොහෝ දුරට සිදුවන්නේ සමස්ත පරිවෘත්තීය මැනීමේ තාක්ෂණික සීමාවන් නිසාය. වෙනත් හේතුකාරක යාන්ත්‍රණ තෝරා ගැනීමේදී උපකල්පිත-ධාවන ක්‍රම විශේෂයෙන් ප්‍රයෝජනවත් වුවද, ජෛව රසායනික ජාල පිළිබඳ අපගේ අවබෝධය ඉදිරියට ගෙන යාමේ ඒවායේ හැකියාව සමකාලීන දත්ත-තීව්‍ර විද්‍යාවේ දැනට පවතින පරිගණක ක්‍රමවලට වඩා සීමිතය. එබැවින්, පුරෝකථනය කළ නොහැකි න්‍යායන් පවතින දත්තවල විෂය පථයෙන් බොහෝ ඔබ්බට ය, එබැවින් පර්යේෂණ ක්ෂේත්‍රයේ ප්‍රගතියේ උපකල්පිත සූත්‍රය/පරීක්ෂණ චක්‍රය අහෝසි කළ නොහැක (4). මෙහි හඳුන්වා දී ඇති පරිවෘත්තීය විද්‍යාවේ පරිගණකමය වැඩ ප්‍රවාහය පරිවෘත්තීය විවිධත්වයේ මෑත (කෙසේද) සහ අවසාන (ඇයි) ගැටළු කෙරෙහි උනන්දුව නැවත ඇති කළ හැකි බවත්, න්‍යායාත්මකව මඟ පෙන්වන දත්ත විද්‍යාවේ නව යුගයකට දායක විය හැකි බවත් අපි පුරෝකථනය කරමු. පෙර පරම්පරාවන්ට ආභාෂය ලබා දුන් වැදගත් න්‍යායන් යුගය නැවත පරීක්ෂා කළේය.
සෘජු ශාකභක්ෂක පෝෂණය සිදු කරනු ලබන්නේ තනි රෝස මල් පිපෙන ශාකයක සුදුමැලි පැහැති පිච්චර් ශාක පත්‍රයක් මත දෙවන ක්ෂණික කීටයන් හෝ Sl කීටයන් ඔසවා තැබීමෙනි, එක් ශාකයකට ශාක අනුපිටපත් 10 ක් ඇත. කෘමි කීටයන් කලම්ප වලින් තද කර, ඉතිරි පත්‍ර පටක ආසාදනය වීමෙන් පැය 24 සහ 72 කට පසුව එකතු කර ඉක්මනින් ශීත කළ අතර පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය නිස්සාරණය කරන ලදී.
ශාකභක්ෂක ප්‍රතිකාර ඉතා සමමුහුර්ත ආකාරයකින් අනුකරණය කරන්න. රෙදිපිළි මාලයේ වර්ධන අවධියේදී ශාකයේ සම්පූර්ණයෙන්ම ප්‍රසාරණය වූ කොළ තුනේ මැද නාරටියේ දෙපස කටු පේළි තුනක් සිදුරු කිරීම සඳහා රෙදි රටා රෝද භාවිතා කිරීම සහ වහාම 1:5 තනුක කළ Ms යෙදීම හෝ සිදුරු තුවාලයට S1 OS ඇතුළු කිරීමට අත්වැසුම් සහිත ඇඟිලි භාවිතා කිරීම ක්‍රමයයි. ඉහත විස්තර කර ඇති පරිදි කොළයක් අස්වැන්න නෙළා සකස් කරන්න. ප්‍රාථමික පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය සහ ශාක හෝමෝන නිස්සාරණය කිරීම සඳහා කලින් විස්තර කරන ලද ක්‍රමය භාවිතා කරන්න (54).
බාහිර JA යෙදීම් සඳහා, එක් එක් විශේෂයේ රෝස මල් පිපෙන ශාක හයේ එක් එක් පොල් බීඩංග කොළ තුන, 150μg MeJA (Lan + MeJA) අඩංගු ලැනොලින් පේස්ට් 20μl සහ ලැනොලින් 20μl සහ තුවාල ප්‍රතිකාර (Lan + W) සමඟ ප්‍රතිකාර කරනු ලැබේ, නැතහොත් පාලනයක් ලෙස පිරිසිදු ලැනොලින් 20μl භාවිතා කරයි. ප්‍රතිකාර කිරීමෙන් පැය 72 කට පසු කොළ අස්වනු නෙළා, ද්‍රව නයිට්‍රජන් වල ක්ෂණිකව ශීත කර, භාවිතය තෙක් -80°C හි ගබඩා කර ඇත.
අපගේ පර්යේෂණ කණ්ඩායම තුළ irAOC (36), irCOI1 (55), irACO සහ sETR1 (48) යන JA සහ ET සංක්‍රාන්ති රේඛා හතරක් හඳුනාගෙන ඇත. irAOC JA සහ JA-Ile මට්ටම්වල අඩුවීමක් ප්‍රබල ලෙස පෙන්නුම් කළ අතර irCOI1 JAs වලට සංවේදී නොවීය. EV සමඟ සසඳන විට, JA-Ile සමුච්චය වැඩි විය. ඒ හා සමානව, irACO ET නිෂ්පාදනය අඩු කරනු ඇති අතර, EV සමඟ සසඳන විට, ET වලට සංවේදී නොවන sETR1, ET නිෂ්පාදනය වැඩි කරනු ඇත.
ET මිනුම් ආක්‍රමණශීලී නොවන ලෙස සිදු කිරීම සඳහා ෆොටෝඅවුස්ටික් ලේසර් වර්ණාවලීක්ෂයක් (Sensor Sense ETD-300 තත්‍ය කාලීන ET සංවේදකය) භාවිතා කරයි. ප්‍රතිකාර කිරීමෙන් පසු වහාම කොළ වලින් අඩක් කපා 4-ml මුද්‍රා තැබූ වීදුරු කුප්පියකට මාරු කරන ලද අතර, හිස් අවකාශය පැය 5ක් ඇතුළත රැස් වීමට ඉඩ දෙන ලදී. මිනුම් අතරතුර, සෑම කුප්පියක්ම මිනිත්තු 8ක් සඳහා පැයකට ලීටර් 2 ක පිරිසිදු වාතයකින් සෝදා හරින ලද අතර, එය කලින් CO2 සහ ජලය ඉවත් කිරීම සඳහා සංවේදක සෙන්ස් විසින් සපයන ලද උත්ප්‍රේරකයක් හරහා ගමන් කර තිබුණි.
ක්ෂුද්‍ර අරා දත්ත මුලින් (35) හි ප්‍රකාශයට පත් කරන ලද අතර ජෛව තාක්‍ෂණ තොරතුරු සඳහා වූ ජාතික මධ්‍යස්ථානයේ (NCBI) ජාන ප්‍රකාශන විස්තීර්ණ දත්ත සමුදායේ (ප්‍රවේශ අංකය GSE30287) සුරකින ලදී. W + OSM ප්‍රතිකාරය සහ හානි නොවූ පාලනය හේතුවෙන් ඇති වූ කොළ වලට අනුරූප දත්ත මෙම අධ්‍යයනය සඳහා උපුටා ගන්නා ලදී. අමු තීව්‍රතාවය log2 වේ. සංඛ්‍යානමය විශ්ලේෂණයට පෙර, මූලික අගය R මෘදුකාංග පැකේජය භාවිතයෙන් එහි 75 වන ප්‍රතිශතයට පරිවර්තනය කර සාමාන්‍යකරණය කරන ලදී.
නිකොටියානා විශේෂවල මුල් RNA අනුක්‍රමික (RNA-seq) දත්ත NCBI කෙටි කියවීමේ ලේඛනාගාරයෙන් (SRA) ලබා ගන්නා ලදී, ව්‍යාපෘති අංකය PRJNA301787 වන අතර එය Zhou et al විසින් වාර්තා කරන ලදී. (39) සහ (56) හි විස්තර කර ඇති පරිදි ඉදිරියට යන්න. නිකොටියානා විශේෂවලට අනුරූප වන W + W, W + OSM සහ W + OSS1 මගින් සකසන ලද අමු දත්ත මෙම අධ්‍යයනයේ දී විශ්ලේෂණය සඳහා තෝරාගෙන පහත පරිදි සකසන ලදී: පළමුව, අමු RNA-seq කියවීම් FASTQ ආකෘතියට පරිවර්තනය කරන ලදී. HISAT2 FASTQ SAM බවට පරිවර්තනය කරයි, සහ SAMtools SAM ගොනු වර්ග කළ BAM ගොනු බවට පරිවර්තනය කරයි. ජාන ප්‍රකාශනය ගණනය කිරීම සඳහා StringTie භාවිතා කරන අතර, එහි ප්‍රකාශන ක්‍රමය වන්නේ අනුක්‍රමික පිටපත් කිරීමේ කොටස් මිලියනයකට පාදක කොටස් දහසකට කොටස් තිබීමයි.
විශ්ලේෂණය සඳහා භාවිතා කරන ලද ඇක්ලයිම් වර්ණදේහ තීරුව (150 mm x 2.1 mm; අංශු ප්‍රමාණය 2.2μm) සහ 4 mm x 4 mm ආරක්ෂක තීරුව එකම ද්‍රව්‍යයකින් සමන්විත වේ. ඩයෝනෙක්ස් අල්ටිමේට් 3000 අල්ට්‍රා හයි පර්ෆෝමන්ස් ද්‍රව වර්ණදේහ (UHPLC) පද්ධතියේ පහත ද්විමය අනුක්‍රමණය භාවිතා වේ: මිනිත්තු 0 සිට 0.5 දක්වා, සමස්ථානික 90% A [ඩයෝනීකරණය කළ ජලය, 0.1% (v/v) ඇසිටෝනයිට්‍රයිල් සහ 0.05% ෆෝමික් අම්ලය], 10% B (ඇසිටෝනයිට්‍රයිල් සහ 0.05% ෆෝමික් අම්ලය); මිනිත්තු 0.5 සිට 23.5 දක්වා, අනුක්‍රමික අවධිය පිළිවෙලින් 10% A සහ ​​90% B වේ; මිනිත්තු 23.5 සිට 25 දක්වා, සමස්ථානික 10% A සහ ​​90% B. ප්‍රවාහ අනුපාතය 400μl/min වේ. සියලුම MS විශ්ලේෂණයන් සඳහා, ධනාත්මක අයනීකරණ මාදිලියේ ක්‍රියාත්මක වන විද්‍යුත් ඉසින ප්‍රභවයකින් සමන්විත චතුර්ධ්‍රැව සහ පියාසැරි කාල (qTOF) විශ්ලේෂකයකට තීරු ප්‍රත්‍යාවර්තකය එන්නත් කරන්න (කේශනාලිකා වෝල්ටීයතාවය, 4500 V; කේශනාලිකා පිටවීම 130 V; වියළන උෂ්ණත්වය 200°C; වියළන වායු ප්‍රවාහය ලීටර් 10/මිනි).
සමස්ත හඳුනාගත හැකි පරිවෘත්තීය පැතිකඩ පිළිබඳ ව්‍යුහාත්මක තොරතුරු ලබා ගැනීම සඳහා දත්ත වලින් අදාළ නොවන හෝ වෙන්කර හඳුනාගත නොහැකි MS / MS කොටස් විශ්ලේෂණය (මෙතැන් සිට MS / MS ලෙස හැඳින්වේ) සිදු කරන්න. විචක්ෂණශීලී MS/MS ක්‍රමයේ සංකල්පය රඳා පවතින්නේ චතුරස්‍රයට ඉතා විශාල ස්කන්ධ හුදකලා කවුළුවක් ඇති බව මත ය [එබැවින්, සියලුම ස්කන්ධ-ආරෝපණ අනුපාතය (m/z) සංඥා කොටස් ලෙස සලකන්න]. මේ හේතුව නිසා, බලපෑම් II උපකරණයට CE ඇලවීමක් නිර්මාණය කිරීමට නොහැකි වූ නිසා, වැඩි වූ ගැටුම්-ප්‍රේරිත විඝටන ඝට්ටන ශක්තිය (CE) අගයන් භාවිතා කරමින් ස්වාධීන විශ්ලේෂණ කිහිපයක් සිදු කරන ලදී. කෙටියෙන් කිවහොත්, පළමුව UHPLC-ඉලෙක්ට්‍රෝස්ප්‍රේ අයනීකරණය/qTOF-MS මගින් තනි ස්කන්ධ වර්ණාවලීක්ෂමිතික මාදිලිය (ප්‍රභව ඛණ්ඩනය මගින් ජනනය කරන ලද අඩු ඛණ්ඩන තත්වයන්) භාවිතයෙන් නියැදිය විශ්ලේෂණය කරන්න, 5 Hz පුනරාවර්තන සංඛ්‍යාතයකින් m/z 50 සිට 1500 දක්වා ස්කෑන් කිරීම. MS/MS විශ්ලේෂණය සඳහා ඝට්ටන වායුව ලෙස නයිට්‍රජන් භාවිතා කරන්න, සහ පහත සඳහන් විවිධ ඝට්ටන-ප්‍රේරිත විඝටන වෝල්ටීයතා හතරේදී ස්වාධීන මිනුම් සිදු කරන්න: 20, 30, 40 සහ 50 eV. මිනුම් ක්‍රියාවලිය පුරාම, චතුරස්‍රයට විශාලතම ස්කන්ධ හුදකලා කවුළුව ඇත, m/z 50 සිට 1500 දක්වා. ඉදිරිපස දේහය m/z සහ හුදකලා පළල අත්හදා බැලීම 200 ලෙස සකසා ඇති විට, උපකරණයේ මෙහෙයුම් මෘදුකාංගය සහ 0 Da මගින් ස්කන්ධ පරාසය ස්වයංක්‍රීයව සක්‍රිය වේ. තනි ස්කන්ධ මාදිලියේ මෙන් ස්කන්ධ කොටස් සඳහා ස්කෑන් කරන්න. ස්කන්ධ ක්‍රමාංකනය සඳහා සෝඩියම් ෆෝමේට් (50 ml isopropanol, 200 μl ෆෝමික් අම්ලය සහ 1 ml 1M NaOH ජලීය ද්‍රාවණය) භාවිතා කරන්න. බෲකර්ගේ ඉහළ නිරවද්‍යතා ක්‍රමාංකන ඇල්ගොරිතම භාවිතා කරමින්, දී ඇති කාල සීමාවක් තුළ සාමාන්‍ය වර්ණාවලිය ක්‍රියාත්මක කිරීමෙන් පසු දත්ත ගොනුව ක්‍රමාංකනය කරනු ලැබේ. අමු දත්ත ගොනු NetCDF ආකෘතියට පරිවර්තනය කිරීම සඳහා දත්ත විශ්ලේෂණ v4.0 මෘදුකාංගයේ (බෲක් ඩෝල්ටන්, බ්‍රෙමන්, ජර්මනිය) අපනයන කාර්යය භාවිතා කරන්න. MS/MS දත්ත කට්ටලය විවෘත පරිවෘත්තීය දත්ත සමුදාය MetaboLights (www.ebi.ac.uk) හි ප්‍රවේශ අංකය සමඟ සුරකින ලදී. MTBLS1471.
අඩු සහ ඉහළ ඝට්ටන ශක්තිය සහ අලුතින් ක්‍රියාත්මක කරන ලද නීති සඳහා MS1 සහ MS/MS තත්ත්ව සංඥා අතර සහසම්බන්ධතා විශ්ලේෂණය හරහා MS/MS එකලස් කිරීම සාක්ෂාත් කරගත හැකිය. නිෂ්පාදනයේ පූර්වගාමියාගේ ව්‍යාප්තියේ සහසම්බන්ධතා විශ්ලේෂණය සාක්ෂාත් කර ගැනීම සඳහා R ස්ක්‍රිප්ට් භාවිතා කරන අතර, නීති ක්‍රියාත්මක කිරීම සඳහා C# ස්ක්‍රිප්ට් (https://github.com/MPI-DL/indiscriminant-MS-MS-assembly-pipeline) භාවිතා කරයි.
පසුබිම් ශබ්දය නිසා ඇතිවන ව්‍යාජ ධනාත්මක දෝෂ සහ සාම්පල කිහිපයක පමණක් ඇතැම් m/z විශේෂාංග හඳුනා ගැනීමෙන් ඇතිවන ව්‍යාජ සහසම්බන්ධතාවය අඩු කිරීම සඳහා, අපි R පැකේජයේ "පිරවූ උච්ච" ශ්‍රිතය භාවිතා කරමු XCMS (පසුබිම් ශබ්ද නිවැරදි කිරීම සඳහා) "NA" (හඳුනා නොගත් උච්ච) තීව්‍රතාවය ප්‍රතිස්ථාපනය කිරීමට භාවිතා කළ යුතුය. පිරවුම් උච්ච ශ්‍රිතය භාවිතා කරන විට, දත්ත කට්ටලයේ සහසම්බන්ධතා ගණනය කිරීමට බලපාන "0" තීව්‍රතා අගයන් තවමත් බොහෝ ඇත. ඉන්පසු, පිරවූ උච්ච ශ්‍රිතය භාවිතා කරන විට සහ පිරවූ උච්ච ශ්‍රිතය භාවිතා නොකරන විට ලබාගත් දත්ත සැකසුම් ප්‍රතිඵල සංසන්දනය කර, සාමාන්‍ය නිවැරදි කරන ලද ඇස්තමේන්තුගත අගය මත පදනම්ව පසුබිම් ශබ්ද අගය ගණනය කර, පසුව මෙම 0 තීව්‍රතා අගයන් ගණනය කළ පසුබිම් අගය සමඟ ප්‍රතිස්ථාපනය කරමු. පසුබිම් අගය මෙන් තුන් ගුණයක් ඉක්මවූ තීව්‍රතාවය ඇති විශේෂාංග පමණක් අපි සලකා බැලූ අතර ඒවා "සත්‍ය උච්ච" ලෙස සැලකුවෙමු. PCC ගණනය කිරීම් සඳහා, නියැදි පූර්වගාමියාගේ (MS1) m/z සංඥා සහ අවම වශයෙන් සත්‍ය උච්ච අටක් සහිත කොටස් දත්ත කට්ටල පමණක් සලකා බලනු ලැබේ.
සම්පූර්ණ සාම්පලයේ පූර්වගාමී ගුණාත්මක ලක්ෂණයේ තීව්‍රතාවය අඩු හෝ ඉහළ ඝට්ටන ශක්තියකට භාජනය වන එකම ගුණාත්මක ලක්ෂණයේ අඩු කළ තීව්‍රතාවය සමඟ සැලකිය යුතු ලෙස සහසම්බන්ධ වී ඇත්නම් සහ CAMERA මගින් විශේෂාංගය සමස්ථානික උච්චයක් ලෙස ලේබල් කර නොමැති නම්, එය තවදුරටත් අර්ථ දැක්විය හැක. ඉන්පසු, තත්පර 3ක් ඇතුළත හැකි සියලුම පූර්වගාමී-නිෂ්පාදන යුගල ගණනය කිරීමෙන් (උච්ච රඳවා තබා ගැනීම සඳහා ඇස්තමේන්තුගත රඳවා ගැනීමේ කාල කවුළුව), සහසම්බන්ධතා විශ්ලේෂණය සිදු කරනු ලැබේ. m/z අගය පූර්වගාමී අගයට වඩා අඩු වන විට සහ එය ලබා ගන්නා පූර්වගාමී ලෙස දත්ත කට්ටලයේ එකම නියැදි ස්ථානයේ MS/MS ඛණ්ඩනය සිදු වූ විට පමණක්, එය ඛණ්ඩයක් ලෙස සැලකේ.
මෙම සරල නීති දෙක මත පදනම්ව, හඳුනාගත් පූර්වගාමියාගේ m/z අගයන්ට වඩා වැඩි m/z අගයන් සහිත නිශ්චිත කොටස් අපි බැහැර කරමු, සහ පූර්වගාමියා දිස්වන නියැදි ස්ථානය සහ නිශ්චිත කොටස මත පදනම්ව. අපේක්ෂක පූර්වගාමියා ලෙස MS1 මාදිලියේ ජනනය කරන ලද බොහෝ මූලාශ්‍ර කොටස් මගින් ජනනය කරන ලද ගුණාත්මක ලක්ෂණ තෝරා ගැනීමට ද හැකි අතර, එමඟින් අතිරික්ත MS/MS සංයෝග ජනනය වේ. මෙම දත්ත අතිරික්තතාවය අඩු කිරීම සඳහා, වර්ණාවලි වල NDP සමානතාවය 0.6 ඉක්මවන්නේ නම් සහ ඒවා CAMERA විසින් සටහන් කරන ලද වර්ණදේහ "pcgroup" ට අයත් නම්, අපි ඒවා ඒකාබද්ධ කරන්නෙමු. අවසාන වශයෙන්, අපි පූර්වගාමියා සහ කොටස් සමඟ සම්බන්ධ CE ප්‍රතිඵල හතරම අවසාන විසංයෝජනය කරන ලද සංයුක්ත වර්ණාවලියට ඒකාබද්ධ කරන්නේ විවිධ ඝට්ටන ශක්තීන්හිදී එකම m/z අගයක් සහිත සියලුම අපේක්ෂක කඳු මුදුන් අතර ඉහළම තීව්‍රතා උච්චය තෝරා ගැනීමෙනි. පසුකාලීන සැකසුම් පියවර සංයුක්ත වර්ණාවලියේ සංකල්පය මත පදනම් වන අතර ඛණ්ඩනය වීමේ සම්භාවිතාව උපරිම කිරීමට අවශ්‍ය විවිධ CE කොන්දේසි සැලකිල්ලට ගනී, මන්ද සමහර කොටස් නිශ්චිත ගැටුම් ශක්තියක් යටතේ පමණක් අනාවරණය කර ගත හැකිය.
පරිවෘත්තීය පැතිකඩෙහි ප්‍රේරකතාව ගණනය කිරීම සඳහා RDPI (30) භාවිතා කරන ලදී. පරිවෘත්තීය වර්ණාවලි විවිධත්වය (Hj දර්ශකය) ව්‍යුත්පන්න වී ඇත්තේ මාර්ටිනෙස් සහ තවත් අය විසින් විස්තර කරන ලද පහත සමීකරණය භාවිතා කරමින් MS/MS සංඛ්‍යාත ව්‍යාප්තියේ ෂැනන් එන්ට්‍රොපිය භාවිතා කරමින් MS/MS පූර්වගාමීන්ගේ බහුලතාවයෙනි. (8). Hj = −∑i = 1mPijlog2(Pij) එහිදී Pij j-th සාම්පලයේ i-th MS/MS හි සාපේක්ෂ සංඛ්‍යාතයට අනුරූප වේ (j = 1, 2,…, m) (i = 1, 2, …, m) t).
පරිවෘත්තීය නිශ්චිතතාව (Si දර්ශකය) යනු සලකා බලනු ලබන සාම්පල අතර සංඛ්‍යාතයට සාපේක්ෂව දී ඇති MS/MS හි ප්‍රකාශන අනන්‍යතාවය ලෙස අර්ථ දැක්වේ. MS/MS නිශ්චිතතාව Si = 1t (∑j = 1tPijPilog2PijPi) ලෙස ගණනය කෙරේ.
එක් එක් j සාම්පලයේ පරිවෘත්තීය-විශේෂිත δj දර්ශකය සහ MS/MS නිශ්චිතතාවයේ සාමාන්‍යය δj = ∑i = 1mPijSi මැනීමට පහත සූත්‍රය භාවිතා කරන්න.
MS/MS වර්ණාවලි යුගල වශයෙන් පෙළගස්වා ඇති අතර, සමානතාවය ලකුණු දෙක මත පදනම්ව ගණනය කෙරේ. පළමුව, සම්මත NDP (කෝසයින් සහසම්බන්ධතා ක්‍රමය ලෙසද හැඳින්වේ) භාවිතා කරමින්, වර්ණාවලි NDP = (∑iS1 & S2WS1, iWS2, i) 2∑iWS1, i2∑iWS2, i2 අතර කොටස් සමානතාවය ලකුණු කිරීමට පහත සමීකරණය භාවිතා කරන්න. එහිදී S1 සහ S2 අනුරූපව, වර්ණාවලිය 1 සහ වර්ණාවලිය 2 සඳහා මෙන්ම WS1, i සහ WS2 සඳහා, i වර්ණාවලි දෙක අතර i-th පොදු උච්චයේ වෙනස 0.01 Da ට වඩා අඩු උච්ච තීව්‍රතාවය මත පදනම් වූ බර නියෝජනය කරයි. බර පහත පරිදි ගණනය කෙරේ: W = [උච්ච තීව්‍රතාවය] m [ගුණාත්මකභාවය] n, m = 0.5, n = 2, MassBank විසින් යෝජනා කරන ලද පරිදි.
දෙවන ලකුණු කිරීමේ ක්‍රමයක් ක්‍රියාත්මක කරන ලද අතර, එයට MS/MS අතර බෙදාගත් NL විශ්ලේෂණය කිරීම ඇතුළත් විය. මේ සඳහා, අපි MS ඛණ්ඩනය කිරීමේ ක්‍රියාවලියේදී නිතර හමුවන 52 NL ලැයිස්තු සහ දුර්වල වූ නෙපෙන්තස් විශේෂවල ද්විතියික පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍යවල MS/MS වර්ණාවලිය සඳහා කලින් විවරණය කර ඇති වඩාත් නිශ්චිත NL (දත්ත ගොනුව S1) භාවිතා කළෙමු (9, 26). එක් එක් MS/MS සඳහා 1 සහ 0 ද්විමය දෛශිකයක් සාදන්න, පිළිවෙලින් සමහර NL වල වත්මන් සහ නොපවතින ඒවාට අනුරූප වේ. යුක්ලීඩියානු දුර සමානතාවය මත පදනම්ව, එක් එක් ද්විමය NL දෛශික යුගල සඳහා NL සමානතා ලකුණු ගණනය කෙරේ.
ද්විත්ව පොකුරුකරණය සිදු කිරීම සඳහා, අපි බරිත ජාන සම-ප්‍රකාශන විශ්ලේෂණයේ (WGCNA) දිගුවක් මත පදනම් වූ R පැකේජය DiffCoEx භාවිතා කළෙමු. MS/MS වර්ණාවලියේ NDP සහ NL ලකුණු කිරීමේ අනුකෘති භාවිතා කරමින්, සංසන්දනාත්මක සහසම්බන්ධතා අනුකෘතිය ගණනය කිරීමට අපි DiffCoEx භාවිතා කළෙමු. ද්විමය පොකුරුකරණය සිදු කරනු ලබන්නේ “cutreeDynamic” පරාමිතිය method = “hybrid”, cutHeight = 0.9999, deepSplit = T, සහ minClusterSize = 10 ලෙස සැකසීමෙනි. DiffCoEx හි R මූලාශ්‍ර කේතය Tesson et al. (57) විසින් අතිරේක ගොනුව 1 න් බාගත කරන ලදී; අවශ්‍ය R WGCNA මෘදුකාංග පැකේජය https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA හි සොයාගත හැකිය.
MS/MS අණුක ජාල විශ්ලේෂණය සිදු කිරීම සඳහා, අපි NDP සහ NL සමානතා වර්ග මත පදනම්ව යුගල වර්ණාවලි සම්බන්ධතාවය ගණනය කළ අතර, CyFilescape yFiles පිරිසැලසුම් ඇල්ගොරිතම දිගු කිරීමේ යෙදුමේ කාබනික පිරිසැලසුම භාවිතයෙන් ජාල ස්ථල විද්‍යාව දෘශ්‍යමාන කිරීමට Cytoscape මෘදුකාංගය භාවිතා කළෙමු.
දත්ත මත සංඛ්‍යානමය විශ්ලේෂණය සිදු කිරීම සඳහා R අනුවාදය 3.0.1 භාවිතා කරන්න. ද්වි-මාර්ග විචල්‍යතා විශ්ලේෂණය (ANOVA) භාවිතයෙන් සංඛ්‍යානමය වැදගත්කම තක්සේරු කරන ලද අතර, පසුව ටුකීගේ අවංකවම සැලකිය යුතු වෙනස (HSD) පශ්චාත්-හොක් පරීක්ෂණය සිදු කරන ලදී. ශාකභක්ෂක ප්‍රතිකාරය සහ පාලනය අතර වෙනස විශ්ලේෂණය කිරීම සඳහා, එකම විචල්‍යතාවයක් සහිත සාම්පල කාණ්ඩ දෙකෙහි වලිග දෙකක ව්‍යාප්තිය ශිෂ්‍යයාගේ t පරීක්ෂණය භාවිතයෙන් විශ්ලේෂණය කරන ලදී.
මෙම ලිපිය සඳහා අතිරේක ද්‍රව්‍ය සඳහා, කරුණාකර http://advances.sciencemag.org/cgi/content/full/6/24/eaaz0381/DC1 බලන්න.
මෙය Creative Commons Attribution-Non-Commercial බලපත්‍රයේ නියමයන් යටතේ බෙදා හරින ලද විවෘත ප්‍රවේශ ලිපියකි, එය අවසාන භාවිතය වාණිජමය වාසි සඳහා නොවන තාක් කල් සහ මුල් කෘතිය නිවැරදි බව උපකල්පනය කරන තාක් කල්, ඕනෑම මාධ්‍යයකින් භාවිතය, බෙදා හැරීම සහ ප්‍රතිනිෂ්පාදනය කිරීමට ඉඩ සලසයි. යොමුව.
සටහන: අපි ඔබෙන් ඉල්ලා සිටින්නේ ඔබගේ විද්‍යුත් තැපැල් ලිපිනය ලබා දෙන ලෙසයි, එවිට ඔබ පිටුවට නිර්දේශ කරන පුද්ගලයාට ඔබට විද්‍යුත් තැපෑල දැකීමට අවශ්‍ය බවත් එය ස්පෑම් නොවන බවත් දැනගත හැකිය. අපි කිසිදු විද්‍යුත් තැපැල් ලිපිනයක් ග්‍රහණය නොකරමු.
ඔබ අමුත්තෙකු දැයි පරීක්ෂා කිරීමට සහ ස්වයංක්‍රීය ස්පෑම් ඉදිරිපත් කිරීම වැළැක්වීමට මෙම ප්‍රශ්නය භාවිතා කරයි.
තොරතුරු න්‍යාය මගින් විශේෂ පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය සංසන්දනය කිරීම සහ පරීක්ෂණ ආරක්ෂක න්‍යායන් පුරෝකථනය කිරීම සඳහා විශ්වීය මුදල් ඒකකයක් සපයයි.
තොරතුරු න්‍යාය මගින් විශේෂ පරිවෘත්තීය ද්‍රව්‍ය සංසන්දනය කිරීම සහ පරීක්ෂණ ආරක්ෂක න්‍යායන් පුරෝකථනය කිරීම සඳහා විශ්වීය මුදල් ඒකකයක් සපයයි.
©2021 විද්‍යාවේ දියුණුව සඳහා වූ ඇමරිකානු සංගමය. සියලු හිමිකම් ඇවිරිණි. AAAS HINARI, AGORA, OARE, CHORUS, CLOCKSS, CrossRef සහ COUNTER හි හවුල්කරුවෙකි. ScienceAdvances ISSN 2375-2548.